WikiDer > KCNA4

Қол жетімді ақуыз құрылымдары:
Pfam	құрылымдар / ЭКОД
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	құрылымның қысқаша мазмұны

Калий каналының Kv1.4 тандемінің инактивация саласы
	rck4 (кв1.4) калий каналының тандемді инактивациялау аймағының ерітінді құрылымы (1-75 қалдықтары)
Идентификаторлар
Таңба	K_kanal_TID
Pfam	PF07941
InterPro	IPR012897
SCOP2	1kn7 / Ауқымы / SUPFAM
Қол жетімді ақуыз құрылымдары:
Pfam	құрылымдар / ЭКОД
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	құрылымның қысқаша мазмұны

KCNA4
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	KCNA4, HBK4, HK1, HPCN2, HUKII, KCNA4L, KCNA8, KV1.4, PCN2, калий кернеуі бар арна топшасы, мүше 4, MCIDDS
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 176266 MGI: 96661 HomoloGene: 20514 Ген-карталар: KCNA4
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	11-хромосома (адам)
Соңы	30,017,030 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	2-хромосома (тышқан)
Соңы	107,298,502 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• калий каналының белсенділігі; • калий ионымен байланысуы; • иондық каналдың кернеулі белсенділігі; • иондық каналдың белсенділігі; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • калий каналының белсенділігі; • калий арнасының белсенділігі кешіктірілді;
Ұялы компонент	• мембрананың ажырамас компоненті; • жасуша проекциясы; • мембрана; • калий каналы кешені; • жасуша қабығы; • аксон; • плазмалық мембрананың ажырамас компоненті; • дендритикалық омыртқа;
Биологиялық процесс	• иондық трансмембраналық тасымалдауды реттеу; • ионды тасымалдау; • калий ионының тасымалы; • трансмембраналық тасымалдау; • калий ионының трансмембраналық тасымалы; • ақуыз гомолигомеризациясы;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	3739
	16492
	ENSG00000182255
	ENSMUSG00000042604
	P22459
	Q61423
	NM_002233
	NM_021275
	NP_002224
	NP_067250
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

KCNA4

Калий кернеуі бар арнаулы отбасы 4 мүше ретінде белгілі Қ_v1.4 Бұл ақуыз адамдарда кодталған KCNA4 ген.^[5]^[6]^[7] Бұл ықпал етеді жүректің өтпелі сыртқы калий ағымы (Мен_to1), негізгі әсер ететін ток реполяризация жүрек әрекеті потенциалының 1 фазасы.^[8]

Сипаттама

Калий каналдары функционалды және құрылымдық жағынан кернеулі иондық арналардың ең күрделі класын ұсынады. Олардың әртүрлі функциялары нейротрансмиттердің босатылуын, жүректің соғу жиілігін, инсулин секрециясын, нейрондардың қозғыштығын, эпителий электролиттерінің тасымалдануын, тегіс бұлшықеттің жиырылуын және жасуша көлемін реттейді. Дрозофилада дәйектілікке байланысты төрт калий каналының гендері анықталды - шейкер, шоу, шаб және шал - және олардың әрқайсысында адам гомологтары бар екендігі көрсетілген. Бұл ген калий каналының мүшесін, кернеуді, шайкермен байланысты субфамилияны кодтайды. Бұл мүшеде төртінші сегментте шейкер типіндегі қайталануы бар алты мембраналық домен бар. Ол А типіндегі калий тогының класына жатады, оның мүшелері жүректегі әсер потенциалдарының жылдам реполяризацияланатын фазасын реттеуде маңызды болуы мүмкін, демек жүректің әсер ету потенциалының ұзақтығына әсер етуі мүмкін. Бұл геннің кодтау аймағы интронсыз, ал ген адамдағы 1-хромосомада KCNA3 және KCNA10 гендерімен шоғырланған.^[7]

KCNA4 (Kv1.4) құрамында тандем инактивациясының домені бар N терминал. Ол екі қосалқы домендерден тұрады. 1 инактивация домені (ID1, қалдықтар 1-38) 5 айналымға бекітілген икемді N терминалдан тұрады спиральжәне классикалық шар доменіндегі сияқты иондық жолды оқшаулау арқылы жұмыс істейді деп ойлайды. Инактивацияның домені 2 (ID2, қалдықтар 40-50) - бұл гидрофобты қалдықтардың үлкен үлесі бар 2,5 бұралмалы спираль, бұл ID1-ді бекітуге қызмет етеді. цитоплазмалық арнаның беті. Осылайша, ID1-дің рецепторлар сайтына ашық каналда жылдам қол жетімділігіне ықпал ете алады. ID1 және ID2 бірге жұмыс істейді, бұл Kv1.4 арнасын жылдам инактивациялауға әкеледі, бұл қысқа мерзімді пластикадағы арнаның рөлі үшін маңызды.^[9]

Өзара әрекеттесу

KCNA4 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге DLG4,^[10]^[11]^[12]^[13] KCNA2^[14] және DLG1.^[10]^[12]^[15]

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000182255 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000042604 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Филипсон Л.Х., Шефер К, ЛаМендола Дж, Белл Г.И., Штайнер Д.Ф. (желтоқсан 1990). «Адамның ұрық қаңқалық бұлшықетінің калий каналының cDNA RCK4-ке байланысты реттілігі». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 18 (23): 7160. дои:10.1093 / нар / 18.23.7160. PMC 332806. PMID 2263489.
^ Gutman GA, Chandy KG, Grissmer S, Lazdunski M, McKinnon D, Pardo LA, және т.б. (Желтоқсан 2005). «Халықаралық фармакология одағы. LIII. Кернеуі бар калий арналарының номенклатурасы және молекулалық байланысы». Фармакологиялық шолулар. 57 (4): 473–508. дои:10.1124 / пр.57.4.10. PMID 16382104. S2CID 219195192.
^ ^а ^б «Entrez Gene: KCNA4 калий кернеуі бар канал, шайкермен байланысты субфамила, мүше 4».
^ Oudit GY, Kassiri Z, Sah R, Ramirez RJ, Zobel C, Backx PH (мамыр 2001). «Қалыпты және ауру миокардтағы жүректің өтпелі калий ағымының (I (дейін)) молекулалық физиологиясы». Молекулалық және жасушалық кардиология журналы. 33 (5): 851–72. дои:10.1006 / jmcc.2001.1376. PMID 11343410. S2CID 829154.
^ Wissmann R, Bildl W, Oliver D, Beyermann M, Kalbitzer HR, Bentrop D, Fakler B (мамыр 2003). «Kv1.4 нейрондық А типті калий каналының» тандемді инактивациялау аймағының «ерітінді құрылымы және қызметі». Биологиялық химия журналы. 278 (18): 16142–50. дои:10.1074 / jbc.M210191200. PMID 12590144.
^ ^а ^б Inanobe A, Fujita A, Ito M, Tomoike H, Inageda K, Kurachi Y (маусым 2002). «Kir2.3 ішкі түзеткіші қоздырғыш синапстардың постсинаптикалық мембранасында локализацияланған». Американдық физиология журналы. Жасуша физиологиясы. 282 (6): C1396-403. дои:10.1152 / ajpcell.00615.2001. PMID 11997254.
^ Niethammer M, Valtschanoff JG, Kapoor TM, Allison DW, Weinberg RJ, Craig AM, Sheng M (сәуір 1998). «CRIPT, PSD-95 / SAP90 үшінші PDZ доменімен байланысатын жаңа постсинапстық ақуыз». Нейрон. 20 (4): 693–707. дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81009-0. PMID 9581762. S2CID 16068361.
^ ^а ^б Ким Е, Шенг М (1996). «PSD-95 және SAP97 дифференциалды K + каналды кластерлеу белсенділігі, екі байланысты мембранамен байланысты гуанилат киназалары». Нейрофармакология. 35 (7): 993–1000. дои:10.1016/0028-3908(96)00093-7. PMID 8938729. S2CID 23755452.
^ Eldstrom J, Doerksen KW, Steele DF, Fedida D (қараша 2002). «Kv1 калий каналдарындағы PD-байланыстыратын домен N-терминалы». FEBS хаттары. 531 (3): 529–37. дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03572-X. PMID 12435606. S2CID 40689829.
^ Коулман С.К., Ньюком Дж, Прайк Дж, Долли Дж.О. (тамыз 1999). «Адамның ОЖЖ-дегі Kv1 арналарының суббірлік құрамы». Нейрохимия журналы. 73 (2): 849–58. дои:10.1046 / j.1471-4159.1999.0730849.x. PMID 10428084. S2CID 20632070.
^ Eldstrom J, Choi WS, Steele DF, Fedida D (шілде 2003). «SAP97 жанама N-терминал механизмі арқылы Kv1.5 токтарын арттырады». FEBS хаттары. 547 (1–3): 205–11. дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00668-9. PMID 12860415. S2CID 34857270.

Әрі қарай оқу

Скотт Х.С., Литдженс Т, Хопвуд Дж., Моррис СП (қараша 1992). «Альфа-L-идуронидаза (IDUA) генінің I экзонында екі RFLP-ді ПТР анықтау». Адам генетикасы. 90 (3): 327. дои:10.1007 / bf00220095. PMID 1362562. S2CID 22700269.
Gessler M, Grupe A, Grzeschik KH, Pongs O (қараша 1992). «HK1 калий каналының гені FSHB геніне жақын адамның 11p14.1 хромосомасына сәйкес келеді». Адам генетикасы. 90 (3): 319–21. дои:10.1007 / bf00220091. PMID 1487251. S2CID 10237322.
Philipson LH, Hice RE, Schaefer K, LaMendola J, Bell GI, Nelson DJ, Steiner DF (қаңтар 1991). «Адам инсулиномасы мен калий аралы арнасының ксенопустық ооциттеріндегі реттілігі мен функционалды көрінісі». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 88 (1): 53–7. Бибкод:1991 PNAS ... 88 ... 53P. дои:10.1073 / pnas.88.1.53. PMC 50746. PMID 1986382.
Тамкун MM, Knoth KM, Walbridge JA, Kroemer H, Roden DM, Glover DM (наурыз 1991). «Молекулалық клондау және екі қарыншадан шыққан в + кернеулі каналды cDNA-ның сипаттамасы». FASEB журналы. 5 (3): 331–7. дои:10.1096 / fasebj.5.3.2001794. PMID 2001794. S2CID 23737559.
Ким Е, Ниетаммер М, Ротшильд А, Ян Ю.Н., Шенг М (қараша 1995). «Шакер типті К + арналарын мембранамен байланысқан гуанилат киназалар отбасыларымен өзара әрекеттесу арқылы кластерлеу». Табиғат. 378 (6552): 85–8. Бибкод:1995 ж. 378 ... 85K. дои:10.1038 / 378085a0. PMID 7477295. S2CID 4362906.
Klocke R, Roberds SL, Tamkun MM, Gronemeier M, Augustin A, Albrecht B және т.б. (Желтоқсан 1993). «Сегіз K (+) тышқандағы хромосомалық картография - Shaker, Shab, Shaw және Shal тәрізді төрт субфамилияны білдіретін арна гендері». Геномика. 18 (3): 568–74. дои:10.1016 / S0888-7543 (05) 80358-1. PMID 7905852.
Philipson LH, Eddy RL, Shows TB, Bell GI (ақпан 1993). «Адамның калий каналының генін KCNA4 (Kv1.4, PCN2) 11q13.4 -> q14.1 хромосомасына тағайындау». Геномика. 15 (2): 463–4. дои:10.1006 / geno.1993.1094. PMID 8449523.
Niethammer M, Kim E, Sheng M (сәуір 1996). «NMDA рецепторларының суббірліктерінің және PSD-95 мембраналы ассоциацияланған гуанилат киназалар тобының көптеген мүшелерінің C терминалы арасындағы өзара байланыс». Неврология журналы. 16 (7): 2157–63. дои:10.1523 / JNEUROSCI.16-07-02157.1996. PMC 6578538. PMID 8601796.
Ким Е, Шенг М (1997). «PSD-95 және SAP97 дифференциалды K + каналды кластерлеу белсенділігі, екі байланысты мембранамен байланысты гуанилат киназалары». Нейрофармакология. 35 (7): 993–1000. дои:10.1016/0028-3908(96)00093-7. PMID 8938729. S2CID 23755452.
Ким Е, Найсбитт С, Хсуэ Ю.П., Рао А, Ротшильд А, Крейг А.М., Шенг М (ақпан 1997). «GKAP, каналды кластерлеу молекулаларының PSD-95 / SAP90 тұқымдасының гуанилат киназа тәрізді доменімен әрекеттесетін жаңа синаптикалық ақуыз». Жасуша биологиясының журналы. 136 (3): 669–78. дои:10.1083 / jcb.136.3.669. PMC 2134290. PMID 9024696.
Niethammer M, Valtschanoff JG, Kapoor TM, Allison DW, Weinberg RJ, Craig AM, Sheng M (сәуір 1998). «CRIPT, PSD-95 / SAP90 үшінші PDZ доменімен байланысатын жаңа постсинапстық ақуыз». Нейрон. 20 (4): 693–707. дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81009-0. PMID 9581762. S2CID 16068361.
Brenman JE, Topinka JR, Cooper EC, McGee AW, Rosen J, Milroy T және т.б. (Қараша 1998). «Постсинаптикалық тығыздық-93 дендриттік микротүтікшелерге оқшаулау және микротүтікшелермен байланысқан 1А протеинімен өзара әрекеттесу». Неврология журналы. 18 (21): 8805–13. дои:10.1523 / JNEUROSCI.18-21-08805.1998 ж. PMC 6793550. PMID 9786987.
Коулман С.К., Ньюком Дж, Прайк Дж, Долли Дж.О. (тамыз 1999). «Адамның ОЖЖ-дегі Kv1 арналарының суббірлік құрамы». Нейрохимия журналы. 73 (2): 849–58. дои:10.1046 / j.1471-4159.1999.0730849.x. PMID 10428084. S2CID 20632070.
D'Adamo MC, Imbrici P, Sponcichetti F, Pessia M (тамыз 1999). «1 типті эпизодтық атаксия синдромымен байланысты KCNA1 генінің мутациясы кернеудің гетеромерлі K (+) функциясын нашарлатады». FASEB журналы. 13 (11): 1335–45. дои:10.1096 / fasebj.13.11.1335. PMID 10428758. S2CID 12876970.
Hogan A, Shepherd L, Chabot J, Quenneville S, Prescott SM, Topham MK, Gee SH (шілде 2001). «Гамма-синтрофиннің диацилглицеринол-кинамен өзара әрекеттесуі. ПДЗ өзара әрекеттесуімен ядролық оқшаулауды реттеу». Биологиялық химия журналы. 276 (28): 26526–33. дои:10.1074 / jbc.M104156200. PMID 11352924.
Кукович D, Лу GW, Wible B, Steele DF, Fedida D (маусым 2001). «Kv1.5 және Kv1.4 калий каналдарының дискретті аминокоминалдық домені альфа-актинин-2 спектринді қайталауларымен өзара әрекеттеседі». FEBS хаттары. 498 (1): 87–92. дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02505-4. PMID 11389904. S2CID 20622483.
Имамура Ф, Маэда С, Дои Т, Фудзиёси Ю (ақпан 2002). «Екінші PDZ доменін лигандпен байланыстыру PSD-95 калий каналымен Kv1.4 кластерленуін реттейді». Биологиялық химия журналы. 277 (5): 3640–6. дои:10.1074 / jbc.M106940200. PMID 11723117.
Piserchio A, Pellegrini M, Mehta S, Blackman SM, Garcia EP, Marshall J, Mierke DF (наурыз 2002). «SAP90 доменінің PDZ1 домені. Құрылым мен байланыстың сипаттамасы». Биологиялық химия журналы. 277 (9): 6967–73. дои:10.1074 / jbc.M109453200. PMID 11744724.

Сыртқы сілтемелер

Kv1.4 + калий + арнасы АҚШ ұлттық медицина кітапханасында Медициналық тақырып айдарлары (MeSH)
KCNA4 + ақуыз, + адам АҚШ ұлттық медицина кітапханасында Медициналық тақырып айдарлары (MeSH)
Сайтында қол жетімді барлық құрылымдық ақпаратқа шолу PDB үшін UniProt: P15385 (Rat калий кернеуі бар арнаулы семья 4 мүше) PDBe-KB.

Бұл мақалада Америка Құрама Штаттарының Ұлттық медицина кітапханасы, ол қоғамдық домен.

Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR012897

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000182255 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000042604 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid2263489-5] Филипсон Л.Х., Шефер К, ЛаМендола Дж, Белл Г.И., Штайнер Д.Ф. (желтоқсан 1990). «Адамның ұрық қаңқалық бұлшықетінің калий каналының cDNA RCK4-ке байланысты реттілігі». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 18 (23): 7160. дои:10.1093 / нар / 18.23.7160. PMC 332806. PMID 2263489.

[pmid16382104-6] Gutman GA, Chandy KG, Grissmer S, Lazdunski M, McKinnon D, Pardo LA, және т.б. (Желтоқсан 2005). «Халықаралық фармакология одағы. LIII. Кернеуі бар калий арналарының номенклатурасы және молекулалық байланысы». Фармакологиялық шолулар. 57 (4): 473–508. дои:10.1124 / пр.57.4.10. PMID 16382104. S2CID 219195192.

[entrez-7] а ^б «Entrez Gene: KCNA4 калий кернеуі бар канал, шайкермен байланысты субфамила, мүше 4».

[oudit-8] Oudit GY, Kassiri Z, Sah R, Ramirez RJ, Zobel C, Backx PH (мамыр 2001). «Қалыпты және ауру миокардтағы жүректің өтпелі калий ағымының (I (дейін)) молекулалық физиологиясы». Молекулалық және жасушалық кардиология журналы. 33 (5): 851–72. дои:10.1006 / jmcc.2001.1376. PMID 11343410. S2CID 829154.

[pmid12590144-9] Wissmann R, Bildl W, Oliver D, Beyermann M, Kalbitzer HR, Bentrop D, Fakler B (мамыр 2003). «Kv1.4 нейрондық А типті калий каналының» тандемді инактивациялау аймағының «ерітінді құрылымы және қызметі». Биологиялық химия журналы. 278 (18): 16142–50. дои:10.1074 / jbc.M210191200. PMID 12590144.

[pmid11997254-10] а ^б Inanobe A, Fujita A, Ito M, Tomoike H, Inageda K, Kurachi Y (маусым 2002). «Kir2.3 ішкі түзеткіші қоздырғыш синапстардың постсинаптикалық мембранасында локализацияланған». Американдық физиология журналы. Жасуша физиологиясы. 282 (6): C1396-403. дои:10.1152 / ajpcell.00615.2001. PMID 11997254.

[pmid9581762-11] Niethammer M, Valtschanoff JG, Kapoor TM, Allison DW, Weinberg RJ, Craig AM, Sheng M (сәуір 1998). «CRIPT, PSD-95 / SAP90 үшінші PDZ доменімен байланысатын жаңа постсинапстық ақуыз». Нейрон. 20 (4): 693–707. дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81009-0. PMID 9581762. S2CID 16068361.

[pmid8938729-12] а ^б Ким Е, Шенг М (1996). «PSD-95 және SAP97 дифференциалды K + каналды кластерлеу белсенділігі, екі байланысты мембранамен байланысты гуанилат киназалары». Нейрофармакология. 35 (7): 993–1000. дои:10.1016/0028-3908(96)00093-7. PMID 8938729. S2CID 23755452.

[pmid12435606-13] Eldstrom J, Doerksen KW, Steele DF, Fedida D (қараша 2002). «Kv1 калий каналдарындағы PD-байланыстыратын домен N-терминалы». FEBS хаттары. 531 (3): 529–37. дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03572-X. PMID 12435606. S2CID 40689829.

[pmid10428084-14] Коулман С.К., Ньюком Дж, Прайк Дж, Долли Дж.О. (тамыз 1999). «Адамның ОЖЖ-дегі Kv1 арналарының суббірлік құрамы». Нейрохимия журналы. 73 (2): 849–58. дои:10.1046 / j.1471-4159.1999.0730849.x. PMID 10428084. S2CID 20632070.

[pmid12860415-15] Eldstrom J, Choi WS, Steele DF, Fedida D (шілде 2003). «SAP97 жанама N-терминал механизмі арқылы Kv1.5 токтарын арттырады». FEBS хаттары. 547 (1–3): 205–11. дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00668-9. PMID 12860415. S2CID 34857270.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

Navigation