WikiDer > OPN5

OPN5
OPN5
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарOPN5, GPR136, GRP136, PGR12, TMEM13, опсин 5
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 609042 MGI: 2662912 HomoloGene: 72341 Ген-карталар: OPN5
Геннің орналасуы (адам)
6-хромосома (адам)
Хр.6-хромосома (адам)[1]
6-хромосома (адам)
OPN5 үшін геномдық орналасу
OPN5 үшін геномдық орналасу
Топ6p12.3Бастау47,781,982 bp[1]
Соңы47,832,780 bp[1]
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001030051
NM_181744

NM_181753

RefSeq (ақуыз)

NP_859528

NP_861418

Орналасқан жері (UCSC)Chr 6: 47.78 - 47.83 MbХр 17: 42.56 - 42.61 Мб
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Нейропсин Бұл ақуыз адамдарда кодталған OPN5 ген.[5][6][7] Бұл фоторецепторлы ақуыз сезімтал ультрафиолет (ультрафиолет) сәулесі. OPN5 гені тышқан мен адамның геномында, оның мРНҚ экспрессиясы жүйке тіндерінде де табылған. Нейропсин 0 ° C температурада екі рет жарамды және ультрафиолетке сезімтал, гетеротримериканы белсендіреді G ақуызы Сүтқоректілер мен құс тіндеріндегі ги-медиациялы жол.[8][9]

Функция

Опсиндер мүшелері болып табылады G ақуыздармен байланысқан рецепторлар. Адамның нейропсині көзге, миға, аталық безге және жұлында көрінеді. Нейропсин сүтқоректілердің опсин гендерінің құрамына кіретін жеті экзонды субфамилияға жатады перопсин (RRH) және торлы G ақуызымен байланысқан рецептор (RGR). Нейропсин әр түрлі изоформалар балама қосу арқылы жасалған.[7]

Фотохимия

Қалпына келтірілген кезде 11-цис-торлы қабық, тышқан және адамның нейропсиндері 380 нм-де максималды сіңеді. Жарықтандырылған кезде бұл нейропсиндер қараңғыда тұрақты болатын көк сіңіргіш фотоөнімдерге айналады (470 нм). Фотоөнімдер ультрафиолет сіңіргіш түрге қайта оралады, олар қызғылт сары түспен жарықтандырылғанда (> 520 нм).[8]

Филогения

Нейропиндер Go / RGR опсиндер тобының төрт подкладының бірін құрайды, оларды RGR / Go немесе 4-топ деп те атайды. Go / RGR - метазоан немесе жануарлар опсині деп аталатын II типті опсиндердің төрт негізгі субкладтарының бірі. . Go / RGR құрамына Go байланысы кіреді, RGR, перопсиндержәне нейропсиндер. II типті опсиндер төрт подкладтан тұрады: C-опсиндер (цилиндр), R-опсиндер (рабдомерик), Cnidops (cnidarian) және Go / RGR. Осы субкладтардың үшеуі тек Билетерияда болады (барлығы Книдопстан басқалары). Алайда, билатериялық кладтар Cnidops жоқ парфилетикалық таксонды құрайды.[10][11]

Түрлердің таралуы

Нейропсин және оның ортологтар олардың арасында аз мөлшерде эксперименталды түрде табылған адам, үй тышқаны (Бұлшықет бұлшықеті),[5] тауық (Gallus gallus domesticus),[9][12] The Жапон бөденесі (Coturnix japonica),[13] еуропалық сынғыш жұлдыз Amphiura filiformis (теңіз жұлдызына қатысты),[14] The тариград су аюы (Гипсибиус дужардини),[15] және итмұрын Xenopus laevis.[16]

Генетикалық дәйектіліктің жалпыға қол жетімді дерекқорларын іздеу нәтижесінде екі негізгі тармақта нейропсиндік ортологтар табылды Билатерия: протостомалар және дейтеростомалар. Протостомалар арасында жүйкедегі нейропсиндер табылған моллюскалар үкі лимпеті (Lottia gigantea) (теңіз ұлуларының бір түрі) және Тынық мұхиты (Crassostrea gigas), ішінде су бүргесі (Daphnia pulex) (ан буынаяқтылар), және аннелид құрт Capitella teleta.[15]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000124818 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000043972 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ а б Tarttelin EE, Bellingham J, Hankins MW, Foster RG, Lucas RJ (қараша 2003). «Нейропсин (Opn5): сүтқоректілердің жүйке тінінде анықталған жаңа опсин». FEBS хаттары. 554 (3): 410–6. дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 01212-2. PMID 14623103. S2CID 9577067.
  6. ^ Fredriksson R, Höglund PJ, Gloriam DE, Lagerström MC, Schiöth HB (қараша 2003). «Адамдардың жеті эволюциялық жолымен консервленген родопсині G протеиндерімен байланысқан, оларда жақын туыстары жоқ». FEBS хаттары. 554 (3): 381–8. дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 01196-7. PMID 14623098. S2CID 11563502.
  7. ^ а б «Entrez Gene: OPN5 opsin 5».
  8. ^ а б Kojima D, Mori S, Torii M, Wada A, Morishita R, Fukada Y (2011). «Адамдар мен тышқандардағы ультрафиолетке сезімтал фоторецепторлық ақуыз OPN5». PLOS ONE. 6 (10): e26388. Бибкод:2011PLoSO ... 626388K. дои:10.1371 / journal.pone.0026388. PMC 3197025. PMID 22043319.
  9. ^ а б Ямашита, Т .; Охучи, Х .; Томонари, С .; Икеда, К .; Сакай К .; Шичида, Ю. (6 желтоқсан 2010). «Opn5 - ультракүлгін сәулеге сезімтал екі буынды пигмент, G ақуызының Gi кіші түрімен байланысады» (PDF). Ұлттық ғылым академиясының материалдары. 107 (51): 22084–22089. Бибкод:2010PNAS..10722084Y. дои:10.1073 / pnas.1012498107. PMC 3009823. PMID 21135214.
  10. ^ Porter ML, Blasic JR, Bok MJ, Cameron EG, Pringle T, Cronin TW, Robinson PR (қаңтар 2012). «Опсин эволюциясына жаңа жарық шашу». Корольдік қоғамның еңбектері B: Биологиялық ғылымдар. 279 (1726): 3–14. дои:10.1098 / rspb.2011.1819 ж. PMC 3223661. PMID 22012981.
  11. ^ Лигертова М, Пергнер Дж, Козмикова I, Фабиан П, Помбиньо А.Р., Стрнад Н, Пачес Дж, Влчек Č, Бартенк П, Козмик З (2015). «Кубозойлық геном опсиндердің функционалдық әртараптандырылуын және фоторецепторлық эволюцияны жарықтандырады». Ғылыми баяндамалар. 5: 11885. Бибкод:2015 НатСР ... 511885L. дои:10.1038 / srep11885. PMC 5155618. PMID 26154478.
  12. ^ Томонари С, Мигита К, Такаги А, Ноджи С, Охучи Х (шілде 2008). «Тауықтың торлы қабығындағы опсин 5-ке байланысты гендердің көріну заңдылықтары». Даму динамикасы. 237 (7): 1910–22. дои:10.1002 / dvdy.21611. PMID 18570255. S2CID 42113764.
  13. ^ Накане Y, Икегами К, Оно Х, Ямамото Н, Йошида С, Хирунаги К, Эбихара С, Кубо Ю, Йошимура Т (тамыз 2010). «Сүтқоректілердің жүйке тіндерінің опсині (Опсин 5) - құстардағы мидың терең фоторецепторы». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 107 (34): 15264–8. Бибкод:2010PNAS..10715264N. дои:10.1073 / pnas.1006393107. PMC 2930557. PMID 20679218.
  14. ^ Delroisse J, Ullrich-Lüter E, Ortega-Martinez O, Dupont S, Arnone MI, Mallefet J, Flammang P (2014). «Көрінбейтін фауалді емес сынғыш жұлдыздағы жоғары опсиннің әртүрлілігі». BMC Genomics. 15 (1): 1035. дои:10.1186/1471-2164-15-1035. PMC 4289182. PMID 25429842.
  15. ^ а б Hering L, Mayer G (қыркүйек 2014). «Гипсибиус дужардинидің триградты опсин репертуарын талдау панартроподағы опсин гендерінің эволюциясы туралы түсінік береді». Геном биологиясы және эволюциясы. 6 (9): 2380–91. дои:10.1093 / gbe / evu193. PMC 4202329. PMID 25193307.
  16. ^ Карри, Стивен П .; Дохерти, Гейл Х .; Силлар, Кит Т. (10 мамыр 2016). «Терең мидың фоторецепциясы жарықты анықтауды бақа таяқшаларындағы қозғалтқыштың шығысымен байланыстырады». Ұлттық ғылым академиясының материалдары. 113 (21): 6053–8. дои:10.1073 / pnas.1515516113. PMC 4889350. PMID 27166423.

Әрі қарай оқу

Бұл мақалада Америка Құрама Штаттарының Ұлттық медицина кітапханасы, ол қоғамдық домен.