WikiDer > Хромодомин

Chromodomain
Хромодомин
PDB 1pfb EBI.jpg
Поликомды хромодоменнің құрылымы.[1]
Идентификаторлар
ТаңбаХромодомин
PfamPF00385
InterProIPR000953
SMARTSM00298
PROSITEPS50013
SCOP21pfb / Ауқымы / SUPFAM
CDDCD00024

A хромодомин (хроматин oұйымдастырушылық айәр түрлі[2]) Бұл ақуыз құрылымдық домен шамамен 40-50 амин қышқылы қайта құруға және манипуляцияға байланысты белоктарда кездесетін қалдықтар хроматин. Домен өте жоғары сақталған өсімдіктерде де, жануарларда да, көптеген ақуыздарда да кездеседі геномдар, сияқты тышқан. Құрамында хромодомин бар гендер бірнеше балама қосу хромодоменді толығымен тастайтын изоформалар.[3] Жылы сүтқоректілер, құрамында хромодомин бар ақуыздар аспектілері үшін жауап береді гендердің реттелуі хроматинді қайта құруға және түзілуіне байланысты гетерохроматин аймақтар.[4] Құрамында хромодомен бар ақуыздар да байланысады метилденген гистондар[5][6] және пайда болады РНҚ индукцияланған транскрипциялық тыныштық күрделі.[7] Гистон модификациясында хромодомендер өте сақталады. Олар метилденгендігімен және байланысуымен жұмыс істейді лизин хроматин ақуыздарының бетінде болатын және сол арқылы геннің транскрипциясын реттейтін қалдықтар.[8]

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Min J, Zhang Y, Xu RM (тамыз 2003). «Полисом хромодоменін 27-ші лыста метилденген H3 гистонымен спецификалық байланыстырудың құрылымдық негіздері». Genes Dev. 17 (15): 1823–8. дои:10.1101 / gad.269603. PMC 196225. PMID 12897052.
  2. ^ Messmer S, Franke A, Paro R (шілде 1992). «Дрозофила меланогастеріндегі поликомбты хромды доменнің функционалдық рөлін талдау». Genes Dev. 6 (7): 1241–1254. дои:10.1101 / gad.6.7.1241. PMID 1628830.
  3. ^ Таджул-Арифин К, Теасдейл Р, Раваси Т, Хьюм Д.А., Маттик Дж.С. (2003). «Тышқан транскриптомында кодталған құрамында хромодомен бар ақуыздарды анықтау және талдау». Genome Res. 13 (6B): 1416–1429. дои:10.1101 / гр.1015703. PMC 403676. PMID 12819141.
  4. ^ Джонс Д.О., Коуэлл И.Г., Сингх П.Б (2000). «Сүтқоректілердің хромодоминдік ақуыздары: олардың геномды ұйымдастырудағы және экспрессиядағы рөлі». БиоЭсселер. 22 (2): 124–37. CiteSeerX 10.1.1.575.6410. дои:10.1002 / (SICI) 1521-1878 (200002) 22: 2 <124 :: AID-BIES4> 3.0.CO; 2-E. PMID 10655032.
  5. ^ Нильсен PR, Nietlispach D, Мотт HR, Каллаган Дж, Баннистер А, Кузаридес Т, Мурзин А.Г., Мурзина Н.В., Лау ЭД (2002). «Лизин 9-да метилденген Н3 гистонымен байланысқан HP1 хромодоменінің құрылымы». Табиғат. 416 (6876): 103–7. дои:10.1038 / табиғат722. PMID 11882902. S2CID 4423019.
  6. ^ Джейкобс С.А., Хорасанизаде С (2002). «Лизин 9-метилденген гистон Н3 құйрығымен байланысқан HP1 хромодоменінің құрылымы». Ғылым. 295 (5562): 2080–3. дои:10.1126 / ғылым.1069473. PMID 11859155. S2CID 38589662.
  7. ^ Вердел A, Jia S, Gerber S, Sugiyama T, Gygi S, Grewal SI, Moazed D (2004). «RITS кешені арқылы гетерохроматинді RNAi-делдалдықпен тағайындау». Ғылым. 303 (5658): 672–6. дои:10.1126 / ғылым.1093686. PMC 3244756. PMID 14704433.
  8. ^ Yap KL, Чжоу ММ (наурыз 2011). «Ген транскрипциясындағы хромодоменнің лизин метилденуін танудың құрылымы мен механизмдері». Биохимия. 50 (12): 1966–80. дои:10.1021 / bi101885м. PMC 3062707. PMID 21288002.

Сыртқы сілтемелер