Биологиялық мәліметтер базасы
Қарапайым модульдік архитектураны зерттеу құралы (SMART) Бұл биологиялық мәліметтер базасы анықтау және талдау кезінде қолданылады белоктық домендер белоктар тізбегінде[1][2] SMART қолданады профильде жасырылған Марков модельдері бастап салынған бірнеше реттілік белоктар тізбегіндегі ақуыз домендерін анықтау. SMART-тің соңғы шығарылымында 1 204 домен моделі бар.[3] Құру кезінде SMART деректері пайдаланылды Сақталған домендер базасы коллекциясы және оның бөлігі ретінде таратылады InterPro дерекқор.[4] Деректер базасы Еуропалық молекулалық биология зертханасы Гейдельбергте.
Әдебиеттер тізімі
- ^ Schultz J, Milpetz F, Bork P, Ponting CP (мамыр 1998). «SMART, қарапайым модульдік архитектураны зерттеу құралы: сигналдық домендерді анықтау» (PDF). Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 95 (11): 5857–64. Бибкод:1998 PNAS ... 95.5857S. дои:10.1073 / pnas.95.11.5857. PMC 34487. PMID 9600884.
- ^ Летуник I, Деркс Т, Борк П (қаңтар 2009). «SMART 6: соңғы жаңартулар және жаңа әзірлемелер». Нуклеин қышқылдары. 37 (Деректер базасы мәселесі): D229–32. дои:10.1093 / nar / gkn808. PMC 2686533. PMID 18978020.
- ^ Летуник, Ивица; Деркс, Тобиас; Bork, Peer (қаңтар 2015). «SMART: соңғы жаңартулар, жаңа әзірлемелер және 2015 жылғы мәртебе». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 43 (Деректер базасы мәселесі): D257–260. дои:10.1093 / nar / gku949. ISSN 1362-4962. PMC 4384020. PMID 25300481.
- ^ Mulder NJ, Apweiler R, Attwood TK және т.б. (Қыркүйек 2002). «InterPro: ақуыз отбасыларына, домендерге және функционалды сайттарға арналған интеграцияланған құжаттама ресурсы». Қысқаша. Биоинформатика. 3 (3): 225–35. дои:10.1093 / bib / 3.3.225. PMID 12230031.
Сыртқы сілтемелер