WikiDer > U11 сплизеозомды РНҚ

U11 spliceosomal RNA
U11 сплизеозомды РНҚ
U11 қайталама құрылымы.png
Адамның U11 сплитеосомалық РНҚ-ның қайталама құрылымы
Идентификаторлар
ТаңбаU11
РфамRF00548
Басқа деректер
РНҚ түріДжин; snRNA; қосу
Домен (дер)Эукариота
КЕТGO мерзімі GO басталуы керек: GO мерзімі GO басталуы керек: GO мерзімі GO басталуы керек:
СОSO: 0000398
PDB құрылымдарPDBe

The U11 snRNA (кішігірім ядролық рибонуклеин қышқылы) маңызды болып табылады кодталмаған РНҚ ішінде кіші сплизесома ақуыздар кешені, белсендіретін балама қосу механизмі. Кіші сплизесома ұқсас ақуыз компоненттерімен байланысты ірі сплизесома. Ол U11 snRNA-ны тану үшін пайдаланады 5 'қосылатын сайт (функционалды түрде U1 snRNA) while U12 snRNA тану үшін тармақпен байланыстырады 3 'қосылатын сайт (функционалды түрде U2 snRNA).[1]

Екінші құрылым

U11 snRNA а цикл құрылымы 5 'соңымен түйісу учаскесінің кезектілігі (5 's)[2] және төрт сабақты ілмектер құрылымынан тұрады (I-IV). Өсімдіктер, омыртқалылар мен жәндіктер арасындағы U11 снРНҚ-ны құрылымдық салыстыру оның 5 'учаскесінде және 3' орнында діңгек цикл құрылымында құрылымға бүктелгенін көрсетеді.[3]

Жинау жолы кезінде байланыстыру орны

5 'сплит учаскесінің аймағы эукариоттық U12 типтегі 5' түйісу учаскесімен дәйекті комплементарлыққа ие. mRNA алдындағы интрондар. 5 'қосылу алаңы және Sm байланыстыратын сайт болып табылады өте сақталған барлық түрлерде.[3] Сондай-ақ, III сабақ циклі ақуыздармен байланысатын аймақ немесе базалық жұптасу аймағы болып табылады, өйткені ол 'AUCAAGA' нуклеотидтерінің жоғары консервіленген тізбегіне ие.[3]

Баламалы қосылу кезіндегі рөл

Шағын сплизеома механизмі

U11 және U12 snRNPs (кіші сплизеосомалық жол) U1 және U2 snRNP (негізгі сплизеосомалық жол) функционалды аналогтары болып табылады U4 атак/U6 atac snRNPs ұқсас U4/U6. Негізгі түйісу жолынан айырмашылығы U11 және U12 snRNP мРНҚ-мен тұрақты, алдын-ала қалыптасқан U11 / U12 di-snRNP кешені ретінде байланысады. Бұл жеті белокты (65K, 59K, 48K, 35K, 31K, 25K және 20K) пайдалану арқылы жүзеге асырылады. Олардың төртеуі (59K, 48K, 35K және 25K) U11 snRNA-мен байланысты.[4]

Spliceosoma түзілу кезінде U11 және U12 snRNAs-тің 5 'соңы сәйкесінше мРНҚ-ның 5' түйісу учаскесімен және тармақталған реттілігімен өзара әрекеттеседі.[4][5] U11 snRNP а тандемді қайталау U11 snRNP-байланыстырушы күшейткіш (USSE) ретінде белгілі және біріктіру процесін бастайды.[6] U11 және U12 snRNA екеуі де бикомплекс ретінде біріктірілгендіктен, олар сплитеосомаға дейінгі кешенде интрондардың екі ұшы арасында молекулалық көпір түзеді.[4] U11-48K және U11 / U12-65K ақуыздары U12 типті интронның түйісетін орнын таниды және U11 / U12 екі комплексін тұрақтандырады.[6] Spliceosomal кешенін белсендіргеннен кейін U11 snRNA жиынтықтан шығады.

Бұл 5 'сайтты тану және интронды көпір арқылы тану ақуыз-ақуыз, ақуыз-РНҚ және РНҚ-РНҚ өзара әрекеттесуі сплизесомальды комплекстен айырмашылығы, кіші сплизомдық кешенде ерекше.[4] Баламалы сплайсинг ақуыздарды кодтайтын гендік экспрессияның (mRNA) вариациясының кілті болғандықтан, U11 бұл реттеуші процесс үшін өте маңызды және протеомды бассейн. Сондықтан U11 snRNA эволюциялық аспектілері жағынан маңызды.[7]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Эллиот, Дэвид; Ладомери, Майкл (2011). РНҚ молекулалық биологиясы. Оксфорд университетінің баспасы. б. 124.
  2. ^ Рассел AG, Шаретт Дж.М., Спенсер DF, Грей MW (қазан 2006). «Кіші сплисиосоманың алғашқы эволюциялық бастауы». Табиғат. 443 (7113): 863–6. дои:10.1038 / табиғат05228. PMID 17051219.
  3. ^ а б c Schneider C, Will CL, Brosius J, Frilander MJ, Lührmann R (маусым 2004). «Дрозофиладағы эволюциялық әр түрлі U11 кіші ядролық рибонуклеопротеин бөлшегін анықтау» (PDF). Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 101 (26): 9584–9. дои:10.1073 / pnas.0403400101. PMC 470718. PMID 15210936.
  4. ^ а б c г. Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T, Lührmann R (маусым 2004). «Адамның 18S U11 / U12 snRNP құрамында U2 тәуелді сплитеосомада жоқ жаңа белоктар жиынтығы бар». РНҚ. 10 (6): 929–41. дои:10.1261 / rna.7320604. PMC 1370585. PMID 15146077.
  5. ^ Колоссова I, Паджетт Р.А. (наурыз 1997). «U11 snRNA in vivo U12 тәуелді (AU-AC) mRNA алдындағы интрондарының 5 'қосылу орнымен өзара әрекеттеседі». РНҚ. 3 (3): 227–33. PMC 1369475. PMID 9056760.
  6. ^ а б Verbeeren J, Niemelä EH, Turunen JJ, Will CL, Ravantti JJ, Lührmann R, Frilander MJ (наурыз 2010). «Бөлшектеуді басқарудың ежелгі механизмі: U11 snRNP альтернативті қосудың активаторы ретінде». Молекулалық жасуша. 37 (6): 821–33. дои:10.1016 / j.molcel.2010.02.014. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-D5F2-D. PMID 20347424.
  7. ^ Кашяп, Лув; Трипати Парул. «Альтернативті қосылыс: бір ген көптеген ақуыздарды қалай жасай алады» (PDF). биология ғылымы түсіндірді.

Сыртқы сілтемелер