WikiDer > Террабактериялар
| Террабактериялар | |
|---|---|
 | |
| Электронды микрографты сканерлеу туралы Actinomyces israelii (Актинобактериялар) | |
| Ғылыми классификация | |
| Домен: | |
| (ішілмеген): | Террабактериялар Battistuzzi және басқалар, 2004, Battistuzzi & Hedges, 2009 |
| Фила | |
| Синонимдер | |
| |
Террабактериялар Бұл таксон құрамында шамамен үштен екі бөлігі (6,157 сп.) прокариот түрлері, оның ішінде грам оң филасы бар түрлер (Актинобактериялар және Firmicutes) сонымен қатар фила Цианобактериялар, Хлорофлекстер, және Deinococcus-Thermus.[1][2]
Ол өз атын шығарады (терра = «жер») тіршіліктің эволюциялық қысымынан. Террабактериялар қоршаған ортаға төтеп беру сияқты маңызды бейімделулерге ие (мысалы, құрғау, ультра күлгін сәулелену және жоғары тұздану) және оттегі фотосинтез. Сонымен қатар, грам-позитивті таксондардағы жасуша қабырғасының ерекше қасиеттері, жердегі жағдайларға байланысты дамыған, көптеген түрлердің патогенді болуына ықпал етті.[2] Бұл нәтижелер қазіргі кезде жердегі бейімделулер прокариот эволюциясында қазіргі кездегіден гөрі үлкен рөл ойнаған болар еді.[1][2]
Террабактериялар 2004 жылы Actinobacteria, Cyanobacteria және Дейнококк-термус [1] кейінірек Firmicutes пен Chloroflexi-ге дейін кеңейтілді.[2] Басқа филогенетикалық талдаулар [3] осы филаның тығыз байланыстарын қолдады. Террабактерияда орналастырылмаған прокариоттардың көпшілігі таксонға тағайындалды Гидробактериялар [2] (3,203 сп.), Сол түрлердің ортақ атасы үшін алынған ылғалды ортаға қатысты. Шамамен 3 миллиард жыл бұрын террабактериялар мен гидробактериялардың айырмашылықтары туралы тұжырым жасалған, бұл сол кезде құрлықтарды (континенттерді) прокариоттар колониялаған деп болжайды.[2] Террабактериялар мен гидробактериялар бірігіп, 2009 жылға дейін белгілі болған барлық эубактериялардың 99% (9 360 сп.) Құрайтын және олардың фототрофиялық қабілеттерінің тұспалдауы бойынша Селабактерия таксонына орналастырылған үлкен топ құрайды (селалар = жеңіл).[4]
Террабактерияларды жақында сипатталған таксонмен шатастыруға болмайды »Глидобактериялар",[5] ол террабактериялардың кейбір мүшелерін ғана қамтиды, бірақ Firmicutes пен Actinobacteria-ді қоспайды және молекулалық филогенетикалық мәліметтермен расталмайды.[2]
Филогения
Батистуццидің (2009) филогенетикалық талдауы бойынша филогенетикалық ағаш келесі және молекулалық сағат калибрлеу.[1][2]
Жақында жүргізілген молекулалық талдаулар келесі қатынастарды анықтады, олардың өзара байланысы белгісіз болған басқа филалар да бар.[6][7][8][9][10][11]
| Террабактериялар |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Екінші жағынан, Коулман және басқалар (2020 ж.) Құрамды атады Термотогалар, Deinococcus-Thermus, Синергистеттер және байланысты DST Сонымен қатар, талдау бұны ұсынады ультра ұсақ бактериялар (CPR тобы) жақынырақ байланысты Terrabacteria-ға жатуы мүмкін Хлорофлекстер. Осы зерттеуге сәйкес филом Суқұстар кейде кіреді Грациликаттар және филом Фузобактериялар террабактерияларға да, гракиликаттарға да тиесілі болуы мүмкін. Нәтижесі келесідей болды:[12]
| Террабактериялар |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Мүмкін, басқа филогенетикалық талдауларға сәйкес террабактериялар парафилетикалық қабық болып табылады.[13][14]
Пайдаланылған әдебиеттер
- ^ а б c г. Баттицци, Ф. У .; Фейжао, А .; Хеджерлер, S. B. (2004). «Прокариот эволюциясының геномдық уақыт шкаласы: метаногенездің пайда болуы, фототрофия және жерді отарлау туралы түсініктер». BMC эволюциялық биологиясы. 4: 44. дои:10.1186/1471-2148-4-44. PMC 533871. PMID 15535883.
- ^ а б c г. e f ж сағ Баттицци, ФУ; Хеджерлер, SB (2009). «Құрлықтағы тіршілікке ежелгі бейімделген прокариоттардың негізгі қабаты». Молекулалық биология және эволюция. 26 (2): 335–43. дои:10.1093 / molbev / msn247. PMID 18988685.
- ^ Берн, М; Голдберг, Д (2005). «Бактериялық филогенияға арналған өкілдік ақуыздарды автоматты түрде таңдау». BMC эволюциялық биологиясы. 5 (1): 34. дои:10.1186/1471-2148-5-34. PMC 1175084. PMID 15927057.
- ^ Баттицузи, Ф. У., Хеджес, С.Б. 2009. Эубактериялар. Pp. 106-115 өмірдің хрестоматиясында, С.Б. Хеджес пен С. Кумар, Эдс. (Oxford University Press, Нью-Йорк, 2009). http://www.timetree.org/book.php.
- ^ Кавальер-Смит, Т (2006). «Өмір ағашын өтпелі талдаулар арқылы тамырлау». Тікелей биология. 1 (1): 19. дои:10.1186/1745-6150-1-19. PMC 1586193. PMID 16834776.
- ^ Картик Анантараман және т.б. 2016, Мыңдаған микробтық геномдар сулы қабат жүйесіндегі өзара байланысты биогеохимиялық процестерге жарық түсіреді Nature Communications DOI: 10.1038 / ncomms13219
- ^ Паула Б. Матеус Карневали т.б. 2019, Сутегі негізіндегі метаболизм цианобактериялармен туыстас болатын ата-баба белгісі ретінде. Табиғат байланысы 10 (1) · 2019 жылдың желтоқсан айы DOI: 10.1038 / s41467-018-08246-ж
- ^ Джи, М., Жасылдандыру, С., Ванвонтергем, И. және т.б. Атмосфералық газдар Антарктиканың шөлді беткі қабатында алғашқы өндірісті қолдайды. Табиғат 552, 400–403 (2017) дой: 10.1038 / табиғат25014
- ^ Тахон Г. және т.б. 2018, Abditibacterium utsteinense sp. қарашада, мұзсыз Антарктида топырағының сынамаларынан оқшауланған ФБП кандидатының бірінші өсірілетін мүшесі. Syst Appl микробиол. 2018 шілде; 41 (4): 279-290. doi: 10.1016 / j.syapm.2018.01.009. Epub 2018 7 ақпан.
- ^ Кристиан Ринке және басқалар 2013 ж. Микробтық қара заттың филогенезі мен кодтау әлеуеті туралы түсінік. Табиғат көлемі: 499, Беттер: 431-437 doi: 10.1038 / nature12352
- ^ Эмили А Элое-Фадрош және басқалар. 2017, Жаһандық метагеномиялық зерттеу геотермалдық бұлақтарда бактериялардың жаңа кандидаттарын анықтайды. Табиғат байланысы 7 · қаңтар 2016 DOI: 10.1038 / ncomms1047
- ^ Гарет А. Коулман, Адриан А. Дэвин, Тара Махендраража, Анья Шпанг, Филипп Хюгенгольц, Джергелли Дж. Шоллеси, Том А. Уильямс. (2020). Тамырлы филогения ерте бактерия эволюциясын шешеді. Биорксив.
- ^ Hug, L. A. және т.б. 2016, Өмір ағашына жаңа көзқарас. Табиғат микробиологиясы, 1, 16048.
- ^ Чжу, С, Май, У., Пфайфер, В. т.б. (2019) «10575 геномның филогеномикасы Бактериялар мен Архейлер домендерінің эволюциялық жақындығын анықтайды». Табиғат байланысы, 10: 5477