WikiDer > Сортаза

Sortase
Сортаза отбасы
Sortase.png
В тобындағы стрептококктың пилусқа байланысты сортазы С. PDB кірісі 3O0P[1]
Идентификаторлар
ТаңбаСортаза
PfamPF04203
InterProIPR005754
SCOP21ija / Ауқымы / SUPFAM
OPM суперотбасы294
OPM ақуызы1rz2
CDDcd00004

Сортаза тобына жатады прокариоттық ферменттер карбоксил-терминалды тану және бөлу арқылы беткі белоктарды өзгертетін сұрыптау сигналы. Сортаза ферменттерінің көп субстраттары үшін тану сигналы LPXTG (Leu-Pro-any-Thr-Gly), содан кейін жоғары гидрофобты мотивтен тұрады. трансмембраналық реттілік, содан кейін сияқты негізгі қалдықтардың кластері пайда болды аргинин. Бөлшек Thr мен Gly арасында жүреді, Thr қалдықтары арқылы белсенді орынға Cys қалдықтарына өтпелі қосылыс, содан кейін белокты жасуша қабырғасының компоненттеріне ковалентті қосатын транспептидация жүреді. Сортазалар барлығында дерлік кездеседі Грам позитивті бактериялар және анда-санда Грам теріс бактерия (мысалы, Шеванелла шірігі) немесе Архей (мысалы, Methanobacterium thermoautotrophicum), онда LPXTG-дің безендірілуі туралы хабарланбаған.[2][3] Сортаза А болса да, «үйді ұстау» сортазы, әдетте, көптеген ақуыздық нысандарға әсер етеді, басқа сортаза формалары бөлшектеу мотивінің вариантты түрлерін таниды немесе құрастыруды катализдейді. тіректер ішіне пили.[4][5][6]

Реакция

The Алтын стафилококк сортаза - бұл беткі белоктарды жасуша қабырғасына қосатын транспептидаза; ол LPXTG мотивінің Gly және Thr аралықтарын жабады және треониннің карбоксил тобы мен жасуша-қабырға пептидогликанының амин тобы арасында амидтік байланыс түзілуін катализдейді.[7][8]

Биологиялық рөл

Сортазалар арқылы жасуша қабырғаларына бекітілген субстрат ақуыздарына ферменттер, пилиндер және адгезия-делдал болатын үлкен беттік гликопротеидтер жатады. Бұл белоктар көбінесе вируленттілікте, инфекцияда және патогендердің колонизациясында маңызды рөл атқарады.

Беттік ақуыздар тек қоздырғыш пен жануар тіндерінің арасындағы өзара әрекеттесуді ғана емес, сонымен қатар иесінің иммундық реакциясынан бактериялардың құтылуының тапқыр стратегиясын ұсынады. Жағдайда S. aureus ақуыз А, иммуноглобулиндер иесінің тіндеріне шабуыл жасау кезінде микробтық бетке және камуфляж бактерияларына түседі. S. aureus srtA генінің жетіспейтін мутанттары кейбір жер үсті ақуыздарын бекітіп, көрсете алмайды және жануарлардың инфекциясын тудырады. Сортаз секреция жолымен басталатын және олардың сигнал пептидін сигнал пептидазасы арқылы алып тастайтын беткі белоктарға әсер етеді. The S. aureus геном сортаза және секреция гендерінің екі жиынтығын кодтайды. Мұны елестетуге болады S. aureus 20 беткі белокты жасуша қабырғасының қабығына тасымалдау үшін бірнеше жол дамыды.

Ескертіп қой экзосортаза және археосортаза функционалды түрде ұқсас, бірақ сұрыптауға гомологты емес.[9]

Антибиотик ретінде

Сортаза жаңа антибиотиктерге жақсы мақсат болып саналады[10] өйткені олар патогендік бактериялар үшін маңызды белоктар болып табылады және коммерциялық қызығушылықтың шектеулі екендігін кем дегенде бір компания атап өтті.[11]

Құрылым

Бұл топ цистеин пептидазалары тиесілі MEROPS пептидаза тұқымдасы C60 (клан C-) және оған бірнеше сорфазалардың қосалқы мүшелері кіреді.

Сортазалардың тағы бір кіші тұқымдасы (MEROPS-те C60B) бактериялық сортаза B ақуыздарынан тұрады, олардың ұзындығы шамамен 200 қалдық.[12]

Құрылымдық биологияда қолдану

Сортазаның транспептидаза белсенділігі құрылымдық биологтардың көмегімен in vitro фьюжн ақуыздарын түзуде қолданылады. Тану мотиві (LPXTG) қызығушылық тудыратын ақуыздың C-терминалына, ал олиго-глицина мотиві екінші ақуыздың N-терминалына қосылады. Ақуыз қоспасына сортаза қосқаннан кейін, екі пептидтер табиғи пептидтік байланыс арқылы ковалентті байланысады. Бұл реакцияны NMR спектроскопистері NMR көрінбейтін ерігіштік белгілерін алу үшін қолданады [13] және бір мысалда рентгендік кристаллографтардың көмегімен күрделі түзілуге ​​ықпал етеді.[14]

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Cozzi R, Malito E, Nuccitelli A, D'Onofrio M, Martinelli M, Ferlenghi I, Grandi G, Telford JL, Maione D, Rinaudo CD (маусым 2011). «Құрылымды талдау және В тобындағы стрептококктағы С1 сортаза үшін анықталған негізгі қалдықтар мен мотивтердің құрылымдық талдауы және мутагенезі». FASEB журналы. 25 (6): 1874–86. дои:10.1096 / fj.10-174797. PMID 21357525.
  2. ^ Mazmanian SK, Ton-That H, Schneewind O (маусым 2001). «Стефилококк аурасының жасуша қабырғасына беттік ақуыздардың сортаза-катализденген якорьі». Молекулалық микробиология. 40 (5): 1049–57. CiteSeerX 10.1.1.513.4509. дои:10.1046 / j.1365-2958.2001.02411.x. PMID 11401711.
  3. ^ Pallen MJ, Chaudhuri RR, Henderson IR (қазан 2003). «Секрециялық жүйелердің геномдық талдауы». Микробиологиядағы қазіргі пікір. 6 (5): 519–27. дои:10.1016 / j.mib.2003.09.005. PMID 14572546.
  4. ^ Oh SY, Budzik JM, Schneewind O (қыркүйек 2008). «Сортазалар пилиді үш ингредиенттен жасайды». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 105 (37): 13703–4. Бибкод:2008PNAS..10513703O. дои:10.1073 / pnas.0807334105. PMC 2544515. PMID 18784365.
  5. ^ LeMieux J, Вуди S, Камилли А (қыркүйек 2008). «RlrA пилусын құрастырудағы Streptococcus pneumoniae сораздарының рөлдері». Бактериология журналы. 190 (17): 6002–13. дои:10.1128 / JB.00379-08. PMC 2519520. PMID 18606733.
  6. ^ Kang HJ, Coulibaly F, Proft T, Baker EN (қаңтар 2011). Хофман А (ред.) «Spy0129 кристалдық құрылымы, пилус құрастыруға қатысатын, B класындағы Streptococcus pyogenes sortase». PLOS ONE. 6 (1): e15969. Бибкод:2011PLoSO ... 615969K. дои:10.1371 / journal.pone.0015969. PMC 3019223. PMID 21264317.
  7. ^ Мазманиан С.К., Лю Г, Тон-Тэт Х, Шневинд О (шілде 1999). «Staphylococcus aureus sortase, фермент, ақуыздарды жасуша қабырғасына бекітеді». Ғылым. 285 (5428): 760–3. дои:10.1126 / ғылым.285.5428.760. PMID 10427003.
  8. ^ Cossart P, Jonquières R (мамыр 2000). «Сортаза, грам позитивті бактерияларға қарсы терапиялық агенттердің әмбебап нысаны?». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 97 (10): 5013–5. Бибкод:2000PNAS ... 97.5013C. дои:10.1073 / pnas.97.10.5013. PMC 33977. PMID 10805759.
  9. ^ Haft DH, Payne SH, Selengut JD (қаңтар 2012). «Археосортазалар мен экзосортазалар - мембрана транзитін посттрансляциялық модификациямен байланыстыратын кең таралған жүйелер». Бактериология журналы. 194 (1): 36–48. дои:10.1128 / JB.06026-11. PMC 3256604. PMID 22037399.
  10. ^ Maresso AW, Schneewind O (наурыз 2008). «Сортаза инфекцияға қарсы терапияның нысаны ретінде». Фармакологиялық шолулар. 60 (1): 128–41. дои:10.1124 / пр.107.07110. PMID 18321961.
  11. ^ SIGA Technologies (қыркүйек 2006). «14А кестесі». АҚШ-тың бағалы қағаздар және биржалар жөніндегі комиссиясы. Алынған 29 қазан 2009.
  12. ^ Pallen MJ, Lam AC, Antonio M, Dunbar K (наурыз 2001). «Сұрыптардың ұялуы - субстраттардың көптігі?». Микробиологияның тенденциялары. 9 (3): 97–102. дои:10.1016 / S0966-842X (01) 01956-4. PMID 11239768.
  13. ^ Kobashigawa Y, Kumeta H, Ogura K, Inagaki F (наурыз 2009). «Сортаза-негізделген протеинді лигациялау әдісін қолдана отырып, NMR-көрінбейтін ерігіштікті жақсарту тегін бекіту». Биомолекулалық ЯМР журналы. 43 (3): 145–50. дои:10.1007 / s10858-008-9296-5. PMID 19140010.
  14. ^ Ванг Y, Pascoe HG, Brautigam CA, He H, Zhang X (қазан 2013). «Плексиннің белсенді белоктық белсенді доменін Rap GTPase активтендірудің және канондық емес катализдің құрылымдық негіздері». eLife. 2: e01279. дои:10.7554 / eLife.01279. PMC 3787391. PMID 24137545.

Әрі қарай оқу

Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR005754