WikiDer > SMURF1

SMURF1
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	2LAZ, 2LB0, 2LB1, 2LTX, 3PYC
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	SMURF1, SMAD спецификалық E3 ubiquitin протеин лигазы 1
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 605568 MGI: 1923038 HomoloGene: 10712 Ген-карталар: SMURF1
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	7-хромосома (адам)
Соңы	99,144,100 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	5-хромосома (тышқан)
Соңы	144,965,847 bp
Гендік онтология
Молекулалық функция	• R-SMAD байланыстыру; • I-SMAD байланыстыру; • активинді байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • фосфолипидті байланыстыру; • трансфераза белсенділігі; • убивитин-протеин трансфераза белсенділігі; • ГО: 1904264, ГО: 1904822, ГО: 0090622, ГО: 0090302 убивитин протеин лигаза белсенділігі;
Ұялы компонент	• цитоплазма; • цитозол; • мембрана; • жасуша қабығы; • нуклеоплазма; • аксон; • нейрондық жасуша денесі; • митохондрия; • жасушадан тыс экзома;
Биологиялық процесс	• жасушалардың дифференциациясы; • аутофагосоманың нысанаға түсуі; • эктодерманың дамуы; • ақуыз полиубиквитинациясы; • BMP сигнализациясы; • рецепторлардың катаболикалық процесі; • Убиквитинге тәуелді SMAD ақуызының катаболикалық процесі; • сүйектенудің теріс реттелуі; • ақуыздың жасуша бетіне оқшаулануы; • аутофагияға қатысатын вакуольге бағытталған ақуыз; • Убиквитинге тәуелді ақуыздың катаболикалық процесіне қатысатын белоктық увиквитинацияның оң реттелуі; • ақуыздың таралуы; • ядродан ақуыз экспорты; • дендриттің созылуының оң реттелуі; • протеазомамен қозғалатын убивитинге тәуелді ақуыздың катаболикалық процесі; • трансформациялық өсу факторының бета-рецепторлық сигнал беру жолының теріс реттелуі; • өсу факторының өзгеру бета-рецепторларының сигнализациясы; • Wnt сигнализациясы, жазықтық жасуша полярлығы жолы; • митохондриялық деполяризацияға жауап ретінде митофагияның паркинмен қоздырылуы; • аутофагосомаға субстрат локализациясы; • Убиквитинге тәуелді ақуыздың катаболикалық процесі; • BMP сигнал беру жолының теріс реттелуі; • ақуыздың плазмалық мембранаға оқшаулануы; • ақуыздың катаболикалық процесінің оң реттелуі;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	57154
	75788
	ENSG00000284126; ENSG00000198742
	ENSMUSG00000038780
	Q9HCE7
	Q9CUN6
	NM_001199847; NM_020429; NM_181349
	NM_001038627; NM_029438
	NP_001186776; NP_065162; NP_851994
	NP_001033716; NP_083714
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

SMURF1

E3 убиквитин-протеинді лигаза SMURF1 болып табылады фермент адамдарда кодталған SMURF1 ген.^[5]^[6]

Функция

Бұл ген а кодтайды убивитин лигаза рецепторлармен реттелетін SMAD сүйек морфогенетикалық ақуыздағы белоктар (BMP) жол. Ұқсас ақуыз Ксенопус эмбрионалды өрнектің қалыптасуына қатысады. Баламалы сплицинг нәтижесінде әртүрлі изоформаларды кодтайтын бірнеше транскрипт нұсқалары пайда болады. Транскрипцияның қосымша нұсқасы анықталды, бірақ оның толық ұзындығы реттілігі анықталмады.^[6]

Өзара әрекеттесу

SMURF1 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге:

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c ENSG00000198742 GRCh38: Ансамбль шығарылымы 89: ENSG00000284126, ENSG00000198742 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000038780 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Zhu H, Kavsak P, Abdollah S, Wrana JL, Thomsen GH (қыркүйек 1999). «SMAD ubiquitin ligase BMP жолына бағытталған және эмбриональды қалыптың қалыптасуына әсер етеді». Табиғат. 400 (6745): 687–93. дои:10.1038/23293. PMID 10458166. S2CID 204995261.
^ ^а ^б «Entrez Gene: SMURF1 SMAD спецификалық E3 ubiquitin протеин лигазы 1».
^ Ямагучи К, Охара О, Андо А, Нагасе Т (сәуір 2008). «Smurf1 тікелей hPEM-2-ге бағытталған, Cdc42 үшін GEF, убивитин-протеазома жолындағы ақуыздармен өзара әрекеттесу модульдерінің жаңа комбинациясы арқылы». Биол. Хим. 389 (4): 405–13. дои:10.1515 / BC.2008.036. PMID 18208356. S2CID 27505034.
^ Лу К, Инь Х, Вэн Т, Си С, Ли Л, Син Г, Ченг Х, Янг Х, Чжан Л, Хе Ф (тамыз 2008). «CKIP-1 арқылы белсендіру үшін HECT типті увикиттин лигаза Smurf1-дің WW домендеріне сілтеме жасау». Нат. Жасуша Биол. 10 (8): 994–1002. дои:10.1038 / ncb1760. PMID 18641638. S2CID 19216909.
^ Fukunaga E, Inoue Y, Komiya S, Horiguchi K, Goto K, Saitoh M, Miyazawa K, Koinuma D, Hanyu A, Imamura T (желтоқсан 2008). «Smurf2 сүт безі қатерлі ісігі жасушаларының көші-қонын болдырмау үшін Smurf1-дің укивитинге тәуелді деградациясын тудырады». Дж.Биол. Хим. 283 (51): 35660–7. дои:10.1074 / jbc.M710496200. PMID 18927080.

Әрі қарай оқу

Wrana JL, Attisano L (2000). «Smad жолы». Цитокиннің өсу факторы. 11 (1–2): 5–13. дои:10.1016 / S1359-6101 (99) 00024-6. PMID 10708948.
Андерссон Б, Вентланд М.А., Рикафренте Дж., Лю В, Гиббс Р.А. (1996). «Мылтық кітапханасын жақсартуға арналған» қос адаптер «әдісі». Анал. Биохимия. 236 (1): 107–13. дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Ю В, Андерссон Б, Уорли К.С., Музни Д.М., Динг Ю, Лю В, Рикафренте Дж., Вентленд М.А., Леннон Г, Гиббс Р.А. (1997). «Үлкен масштабты біріктіру cDNA тізбегі». Genome Res. 7 (4): 353–8. дои:10.1101 / гр.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Нагасе Т, Кикуно Р, Накаяма М, Хиросава М, Охара О (2001). «Адамның анықталмаған гендерінің кодтау ретін болжау. XVIII. Ірі протеиндерді in vitro кодтайтын мидан 100 жаңа кДНК клондарының толық тізбегі». DNA Res. 7 (4): 273–81. дои:10.1093 / dnares / 7.4.271. PMID 10997877.
Эбисава Т, Фукучи М, Мураками Г, Чиба Т, Танака К, Имамура Т, Миязоно К (2001). «Smurf1 Smad7 арқылы өзгеретін өсу фактор-бета I типті рецептормен әрекеттеседі және рецепторлардың деградациясын тудырады». Дж.Биол. Хим. 276 (16): 12477–80. дои:10.1074 / jbc.C100008200. PMID 11278251.
Suzuki C, Murakami G, Fukuchi M, Shimanuki T, Shikauchi Y, Imamura T, Miyazono K (2002). «Smurf1 плазмалық мембранаға Smad7 бағыттау арқылы Smad7 ингибиторлық белсенділігін реттейді». Дж.Биол. Хим. 277 (42): 39919–25. дои:10.1074 / jbc.M201901200. PMID 12151385.
Таджима Ю, Гото К, Йошида М, Шиномия К, Секимото Т, Йонеда Ю, Миязоно К, Имамура Т (2003). «Smad7-ге өзгеретін өсу факторы-бета сигнализациясының теріс реттелуі үшін хромосомалық аймақты қолдау 1 (CRM1) тәуелді ядролық экспорты, Smad ubikuitin реттеуші факторы 1 (Smurf1)». Дж.Биол. Хим. 278 (12): 10716–21. дои:10.1074 / jbc.M212663200. PMID 12519765.
Коинума Д, Шинозаки М, Комуро А, Гото К, Сайто М, Ханю А, Эбина М, Нукива Т, Миядзава К, Имамура Т, Миязоно К (2004). «Arkadia Smad7 деградациясы арқылы TGF-бета суперотбасылық сигнализацияны күшейтеді». EMBO J. 22 (24): 6458–70. дои:10.1093 / emboj / cdg632. PMC 291827. PMID 14657019.
Wang HR, Zhang Y, Ozdamar B, Ogunjimi AA, Alexandrova E, Thomsen GH, Wrana JL (2003). «Деградацияға RhoA-ны бағыттау арқылы жасуша полярлығын және шығыңқы түзілуін реттеу». Ғылым. 302 (5651): 1775–9. дои:10.1126 / ғылым.1090772. PMID 14657501. S2CID 21530222.
Asano Y, Ihn H, Yamane K, Kubo M, Tamaki K (2004). «Склеродермалық фибробласттардағы TGF-бета сигнализациясының Smad7-Smurf-медиациясының теріс реттелуінің бұзылуы». J. Clin. Инвестиция. 113 (2): 253–64. дои:10.1172 / JCI16269. PMC 310747. PMID 14722617.
Jin YH, Jeon EJ, Li QL, Lee YH, Choi JK, Kim WJ, Lee KY, Bae SC (2004). «Трансформацияланған өсу факторы-бета p300-ге тәуелді RUNX3 ацетилденуін ынталандырады, бұл барлық жерде беттестіру нәтижесінде болатын деградацияны тежейді». Дж.Биол. Хим. 279 (28): 29409–17. дои:10.1074 / jbc.M313120200. PMID 15138260.
Shearwin-Whyatt LM, Brown Brown, Wylie FG, Stow JL, Kumar S (2005). «Nedd4-өзара әрекеттесетін ақуыз N4WBP5A (Ndfip2), мультиварикулярлық денелер мен Гольджиде локализацияланған және ақуыз айналымында әлеуетті рөлге ие». J. Cell Sci. 117 (Pt 16): 3679–89. дои:10.1242 / jcs.01212. PMID 15252135.
Bryan B, Cai Y, Wrighton K, Wu G, Feng XH, Liu M (2005). «RhoA-ны Smurf1-мен жерсіндіру нейриттердің өсуіне ықпал етеді». FEBS Lett. 579 (5): 1015–9. дои:10.1016 / j.febslet.2004.12.074. PMID 15710384. S2CID 36440933.
Barrios-Rodiles M, Brown Brown, Ozdamar B, Bose R, Liu Z, Donovan RS, Shinjo F, Liu Y, Dembowy J, Taylor IW, Luga V, Przulj N, Робинсон М, Сузуки Х, Хаяшизаки Ю, Юрисика I, Wrana JL (2005). «Сүтқоректілер клеткаларындағы динамикалық сигнал беру желісінің жоғары өнімділігі». Ғылым. 307 (5715): 1621–5. дои:10.1126 / ғылым.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.

Сыртқы сілтемелер

Сайтында қол жетімді барлық құрылымдық ақпаратқа шолу PDB үшін UniProt: Q9HCE7 (E3 ubiquitin-белокты лигаз SMURF1) PDBe-KB.

Бұл ақуыз- қатысты мақала а бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ENSG00000198742 GRCh38: Ансамбль шығарылымы 89: ENSG00000284126, ENSG00000198742 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000038780 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid10458166-5] Zhu H, Kavsak P, Abdollah S, Wrana JL, Thomsen GH (қыркүйек 1999). «SMAD ubiquitin ligase BMP жолына бағытталған және эмбриональды қалыптың қалыптасуына әсер етеді». Табиғат. 400 (6745): 687–93. дои:10.1038/23293. PMID 10458166. S2CID 204995261.

[entrez-6] а ^б «Entrez Gene: SMURF1 SMAD спецификалық E3 ubiquitin протеин лигазы 1».

[pmid18208356-7] Ямагучи К, Охара О, Андо А, Нагасе Т (сәуір 2008). «Smurf1 тікелей hPEM-2-ге бағытталған, Cdc42 үшін GEF, убивитин-протеазома жолындағы ақуыздармен өзара әрекеттесу модульдерінің жаңа комбинациясы арқылы». Биол. Хим. 389 (4): 405–13. дои:10.1515 / BC.2008.036. PMID 18208356. S2CID 27505034.

[pmid18641638-8] Лу К, Инь Х, Вэн Т, Си С, Ли Л, Син Г, Ченг Х, Янг Х, Чжан Л, Хе Ф (тамыз 2008). «CKIP-1 арқылы белсендіру үшін HECT типті увикиттин лигаза Smurf1-дің WW домендеріне сілтеме жасау». Нат. Жасуша Биол. 10 (8): 994–1002. дои:10.1038 / ncb1760. PMID 18641638. S2CID 19216909.

[pmid18927080-9] Fukunaga E, Inoue Y, Komiya S, Horiguchi K, Goto K, Saitoh M, Miyazawa K, Koinuma D, Hanyu A, Imamura T (желтоқсан 2008). «Smurf2 сүт безі қатерлі ісігі жасушаларының көші-қонын болдырмау үшін Smurf1-дің укивитинге тәуелді деградациясын тудырады». Дж.Биол. Хим. 283 (51): 35660–7. дои:10.1074 / jbc.M710496200. PMID 18927080.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

Navigation