WikiDer > Палладин

ПАЛЛД
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	2DM2, 2DM3
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	ПАЛЛД, CGI-151, CGI151, MYN, PNCA1, SIH002, палладин, цитоскелеттік байланысқан ақуыз
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 608092 MGI: 1919583 HomoloGene: 75052 Ген-карталар: ПАЛЛД
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	4-хромосома (адам)
Соңы	168,928,457 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	8-хромосома (тышқан)
Соңы	61,902,690 bp
Гендік онтология
Молекулалық функция	• бұлшықет альфа-актининді байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • актинмен байланыстыру; • жасуша жасушаларының адгезиясына қатысатын ақуыз байланысы;
Ұялы компонент	• жасуша проекциясы; • фокальды адгезия; • өсу конусы; • руфль; • жасуша қабығы; • аксон; • жасушалық түйісу; • Z дискісі; • актиндік жіп; • цитиннің актині; • подосомалар; • цитоскелет; • жасуша ядросы; • ламелиподий; • цитоплазма; • цитозол;
Биологиялық процесс	• эпителий жасушаларының морфогенезі; • кератиноциттердің дамуы; • цитоскелетті ұйымдастыру; • цитиннің актинді ұйымы; • жасуша миграциясы; • плазмалық мембрана адгезиясының молекулалары арқылы гомофильді жасушалардың адгезиясы; • аксондық нұсқаулық; • дендриттен аулақ болу;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	23022
	72333
	ENSG00000129116
	ENSMUSG00000058056
	Q8WX93
	Q9ET54
NM_001166108; NM_001166109; NM_001166110; NM_016081; NM_001367567;
	NM_001367568; NM_001367569; NM_001367570
	NM_001081390; NM_001293772; NM_001293773; NM_001293774
NP_001159580; NP_001159581; NP_001159582; NP_057165; NP_001354496;
	NP_001354497; NP_001354498; NP_001354499
	NP_001074859; NP_001280701; NP_001280702; NP_001280703
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Palladin

Палладин Бұл ақуыз адамдарда кодталған ПАЛЛД ген.^[5]^[6]^[7]^[8] Палладин - құрамдас бөлігі актин- жасуша формасын бақылайтын микрофиламенттерден тұратын, адгезияжәне жиырылу.^[8]

Ашу

Палладинді екі зерттеу тобы тәуелсіз сипаттады, алдымен Кэрол Отидің зертханасында (2000 ж.)^[6] содан кейін Олли Карпен зертханасында (2001 ж.).^[9] Бұл миотилин-миопалладин-палладин отбасының бөлігі және оны модуляциялауда маңызды рөл атқаруы мүмкін актин цитоскелет.^[10] Палладин, керісінше миотилин және миопалладин, тек оларда көрсетілген жолақты бұлшықет, барлық жерде ұяшықтарда өрнектеледі мезенхималық шығу тегі.

Палладин итальяндық Ренессанс сәулетшісінің есімімен аталды Андреа Палладио, оны жасушаның сәулеттік элементтеріне оқшаулауды көрсететін.^[6]

Эукариотты цитоскелет. Палладин - бұл күрделі ұялы машинаның бір бөлігі.

Isoforms

Адамдарда жеті түрлі изоформалар бар, олардың кейбіреулері пайда болады балама қосу.^[11] Тышқандарда палладиннің үш негізгі изоформасы бір геннен пайда болады. Бұл изоформалар Ig-тәрізді доменнің үштен беске дейінгі (изоформасына байланысты) және полипролиндік доменнің бір-екі данасының арасында болады.^[6]

Функция

Палладиннің нақты биологиялық рөлі өте аз зерттелген, бірақ оның цитоскелетті ұйымдасуында, эмбрионның дамуында, жасушалардың қозғалғыштығында, терінің тыртық түзілуінде және жүйке жасушаларының дамуында рөлі бар екендігі дәлелденген.^[10]

Аурудың байланысы

Жақында бұл палладин екенін көрсетті РНҚ бар науқастарда шамадан тыс әсер етеді ұйқы безі неоплазия, ал палладин шамадан тыс әсер етеді және тұқым қуалайтын түрінде мутацияға ұшырайды ұйқы безінің қатерлі ісігі.^[12] Отбасылық панкреатикалық қатерлі ісіктерде анықталған палладиндік мутация тек бір ғана солтүстікамерикалық отбасына тән болуы мүмкін, өйткені дәл осы мутация басқа еуропалық немесе солтүстікамерикалық популяцияларда, сәйкесінше, басқа екі генетикалық зерттеулерде кездеспеген.^[13]^[14]

Әрі қарай, Salaria et al. палладин ұйқы безі қатерлі ісігінің неопластикалық емес стромасында шамадан тыс әсер ететіндігін көрсетті, бірақ рак клеткаларында сирек кездеседі,^[15] палладиннің осы аурудағы рөлі ісік микроорганизмінің өзгеруін қамтуы мүмкін. Бұл протеинге дейін неоплазиядағы оның рөлін толық түсіну үшін көбірек зерттеу қажет.

Ауру туғызатын мутациялар осы гендер отбасының басқа екі мүшесінде де анықталған. Миотилин мутация аяқ-қол белдеуінің бұлшықет дистрофиясының түрін тудырады, ал мутациялар миопалладин жүрек ауруының тұқым қуалайтын түрін тудыруы (кеңейтілген кардиомиопатия).

Өзара әрекеттесу

PALLD көрсетілді өзара әрекеттесу бірге EZR.^[9]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000129116 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000058056 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Нагасе Т, Исикава К, Суяма М, Кикуно Р, Хиросава М, Миядзима Н, Танака А, Котани Х, Номура Н, Охара О (шілде 1999). «Адамның анықталмаған гендерінің кодтау ретін болжау. XIII. Ірі протеиндерді in vitro кодтайтын мидан 100 жаңа кДНК клондарының толық тізбегі». DNA Res. 6 (1): 63–70. дои:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.
^ ^а ^б ^c ^г. Parast MM, Otey CA (қыркүйек 2000). «Палладиннің сипаттамасы, стресс талшықтары мен жасушалық адгезияларға локализацияланған роман протеині». J Cell Biol. 150 (3): 643–56. дои:10.1083 / jcb.150.3.643. PMC 2175193. PMID 10931874.
^ Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). «Адам гендері мен ақуыздарының каталогына қарай: адамның 500 кДНҚ кодтайтын толық романдық ақуыздардың тізбегі мен талдауы». Genome Res. 11 (3): 422–35. дои:10.1101 / гр. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
^ ^а ^б «Entrez Gene: PALLD палладин, цитоскелетпен байланысты ақуыз». nih.gov.
^ ^а ^б Mykkänen OM, Grönholm M, Rönty M, Lalowski M, Salmikangas P, Suila H, Carpén O (2001). «Адам палладинінің сипаттамасы, микрофиламентпен байланысқан ақуыз». Мол. Биол. Ұяшық. 12 (10): 3060–73. дои:10.1091 / mbc.12.10.3060. PMC 60155. PMID 11598191.
^ ^а ^б Otey CA, Rachlin A, Moza M, Arneman D, Carpen O (2005). Палладин / миотилин / миопалладиндер тұқымдасы, актинмен байланысқан тіреуіштер. Int. Аян Цитол. Халықаралық цитология шолу. 246. 31-58 бет. дои:10.1016 / S0074-7696 (05) 46002-7. ISBN 9780123646507. PMID 16164966.
^ Rachlin AS, Otey CA (2006). «Палладин изоформаларын анықтау және Ласп-1 мен палладин арасындағы изоформалық өзара әрекеттесудің сипаттамасы». J. Cell Sci. 119 (Pt 6): 995-1004. дои:10.1242 / jcs.02825. PMID 16492705.
^ Pogue-Geile KL, Chen R, Bronner MP, Crnogorac-Jurcevic T, Moyes KW, Dowen S, Otey CA, Crispin DA, George George, Whitcomb DC, Brentnall TA (2006). «Палладин мутациясы отбасылық асқазан безінің қатерлі ісігін тудырады және қатерлі ісіктің жаңа механизмін ұсынады». PLOS Med. 3 (12): e516. дои:10.1371 / journal.pmed.0030516. PMC 1751121. PMID 17194196.
^ Слейтер Е, Амриллаева В, Фендрих В, Бартш Д, Эрл Дж, Витон LJ, Неоптолемос Дж.П., Гринхалф W (2007). «Палладин мутациясы отбасылық асқазан безінің қатерлі ісігін тудырады: еуропалық отбасыларда жоқ». PLOS Med. 4 (4): e164. дои:10.1371 / journal.pmed.0040164. PMC 1855695. PMID 17455999.
^ Zogopoulos G, Rothenmund H, Eppel A, Ash C, Akbari MR, Hedley D, Narod SA, Gallinger S (2007). «Палладин P239S нұсқасы тұқым қуалайтын немесе ерте басталған ұйқы безі қатерлі ісігінің маңызды бөлігін есепке алмайды». Хум. Генет. 121 (5): 635–7. дои:10.1007 / s00439-007-0361-z. PMID 17415588. S2CID 2445261.
^ Salaria SN, Illei P, Sharma R, Walter KM, Klein AP, Eshleman JR, Maitra A, Schulick R, Winter J, Ouellette MM, Goggins M, Hruban R (2007). «Палладин ұйқы безінің инфильтратты каналды аденокарциномаларының неопластикалық емес стромасында шамадан тыс әсер етеді, бірақ тек жаңа қабықшаларда сирек кездеседі». Қатерлі ісік биолы. Тер. 6 (3): 324–8. дои:10.4161 / cbt.6.3.3904. PMC 3144721. PMID 17404500.

Әрі қарай оқу

King CM, Olive CW, Cardona RA (1975). «Канцерогенді арилгидроксамикалық қышқылдардың адам ұлпаларының активациясы». Дж. Натл. Қатерлі ісік ауруы. 55 (2): 285–7. дои:10.1093 / jnci / 55.2.285. PMID 1159819.
Lai CH, Chou CY, Chang LY және т.б. (2000). «Салыстырмалы протеомика әдісімен ценорхабдита элегандарында эволюциялық жолмен сақталған адамның гендерін анықтау». Genome Res. 10 (5): 703–13. дои:10.1101 / гр.10.5.703. PMC 310876. PMID 10810093.
Bang ML, Mudry RE, McElhinny AS және т.б. (2001). «Миопалладин, Z-Disc және I-Band ақуыздар жиынтығында бірнеше рөлі бар 145 килодальтондық саркомер ақуызы». Дж. Жасуша Биол. 153 (2): 413–27. дои:10.1083 / jcb.153.2.413. PMC 2169455. PMID 11309420.
Mykkänen OM, Grönholm M, Rönty M және т.б. (2002). «Адам палладинінің сипаттамасы, микрофиламентпен байланысқан ақуыз». Мол. Биол. Ұяшық. 12 (10): 3060–73. дои:10.1091 / mbc.12.10.3060. PMC 60155. PMID 11598191.
Eberle MA, Pfützer R, Pogue-Geile KL және т.б. (2002). «Ұйқы безінің аутосомды доминантты қатерлі ісігі карталарының 4q32-34 хромосомасына жаңа сезімталдық орны». Am. Дж. Хум. Генет. 70 (4): 1044–8. дои:10.1086/339692. PMC 379100. PMID 11870593.
Moriyama K, Bonifacino JS (2003). «Паллидин - бұл лизосомамен байланысты органеллалардың биогенезіне қатысатын көп белокты кешеннің құрамдас бөлігі». Трафик. 3 (9): 666–77. дои:10.1034 / j.1600-0854.2002.30908.x. PMID 12191018. S2CID 29888859.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ли SY, Обата Y, Йошида М және т.б. (2003). «Адам саркомасын иммуномиялық талдау». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 100 (5): 2651–6. дои:10.1073 / pnas.0437972100. PMC 151395. PMID 12601173.
Ота Т, Сузуки Ю, Нишикава Т және т.б. (2004). «Адамның 21,243 толық ұзындықтағы кДНҚ-ның толық тізбегі және сипаттамасы». Нат. Генет. 36 (1): 40–5. дои:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Рёнти М, Тайвайнен А, Моза М және т.б. (2004). «Палладин мен альфа-актининнің өзара әрекеттесуін молекулалық талдау». FEBS Lett. 566 (1–3): 30–4. дои:10.1016 / j.febslet.2004.04.006. PMID 15147863. S2CID 86151740.
Герхард Д.С., Вагнер Л, Фейнголд Е.А. және т.б. (2004). «NIH толық ұзындықтағы cDNA жобасының мәртебесі, сапасы және кеңеюі: Сүтқоректілердің гендер коллекциясы (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121-7. дои:10.1101 / гр.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS және басқалар. (2005). «Адамның 2 және 4 хромосомаларының ДНҚ тізбектерінің генерациясы және аннотациясы». Табиғат. 434 (7034): 724–31. дои:10.1038 / табиғат03466. PMID 15815621.
Рёнти М, Тайвайнен А, Моза М және т.б. (2005). «Палладин мен альфа-актининнің Abl / Arg киназа адаптерін ArgBP2-ны актин цитокелетіне бағыттауға қатысуы». Exp. Ұяшық Рес. 310 (1): 88–98. дои:10.1016 / j.yexcr.2005.06.026. PMID 16125169.
Шифман Д, Эллис С.Г., Роулэнд CM және т.б. (2005). «Миокард инфарктісімен байланысты төрт гендік нұсқаны анықтау». Am. Дж. Хум. Генет. 77 (4): 596–605. дои:10.1086/491674. PMC 1275608. PMID 16175505.
Бухелифа М, Моза М, Йоханссон Т және т.б. (2006). «Пролинге бай ақуыз палладин - профилин үшін байланыстырушы серіктес». FEBS J. 273 (1): 26–33. дои:10.1111 / j.1742-4658.2005.05036.x. PMID 16367745. S2CID 21207885.
Rönty MJ, Leivonen SK, Hinz B және т.б. (2007). «TGF-бета1-индуцирленген миофибробласт дифференциациясы кезінде актинді ұйымдастыратын палладиннің изоформалық реттелуі». J. Invest. Дерматол. 126 (11): 2387–96. дои:10.1038 / sj.jid.5700427. PMID 16794588.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA және т.б. (2006). «Ақуыздың фосфорлануының анализі және учаскені оқшаулаудың ықтималдыққа негізделген тәсілі». Нат. Биотехнол. 24 (10): 1285–92. дои:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Олсен БК, Благоев Б, Гнад Ф және т.б. (2006). «Сигналды желілердегі ғаламдық, in vivo және нақты фосфорлану динамикасы». Ұяшық. 127 (3): 635–48. дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Сыртқы сілтемелер

палладин + ақуыз, + адам АҚШ ұлттық медицина кітапханасында Медициналық тақырып айдарлары (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000129116 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000058056 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid10231032-5] Нагасе Т, Исикава К, Суяма М, Кикуно Р, Хиросава М, Миядзима Н, Танака А, Котани Х, Номура Н, Охара О (шілде 1999). «Адамның анықталмаған гендерінің кодтау ретін болжау. XIII. Ірі протеиндерді in vitro кодтайтын мидан 100 жаңа кДНК клондарының толық тізбегі». DNA Res. 6 (1): 63–70. дои:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.

[pmid10931874-6] а ^б ^c ^г. Parast MM, Otey CA (қыркүйек 2000). «Палладиннің сипаттамасы, стресс талшықтары мен жасушалық адгезияларға локализацияланған роман протеині». J Cell Biol. 150 (3): 643–56. дои:10.1083 / jcb.150.3.643. PMC 2175193. PMID 10931874.

[pmid11230166-7] Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). «Адам гендері мен ақуыздарының каталогына қарай: адамның 500 кДНҚ кодтайтын толық романдық ақуыздардың тізбегі мен талдауы». Genome Res. 11 (3): 422–35. дои:10.1101 / гр. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.

[entrez-8] а ^б «Entrez Gene: PALLD палладин, цитоскелетпен байланысты ақуыз». nih.gov.

[pmid11598191-9] а ^б Mykkänen OM, Grönholm M, Rönty M, Lalowski M, Salmikangas P, Suila H, Carpén O (2001). «Адам палладинінің сипаттамасы, микрофиламентпен байланысқан ақуыз». Мол. Биол. Ұяшық. 12 (10): 3060–73. дои:10.1091 / mbc.12.10.3060. PMC 60155. PMID 11598191.

[pmid16164966-10] а ^б Otey CA, Rachlin A, Moza M, Arneman D, Carpen O (2005). Палладин / миотилин / миопалладиндер тұқымдасы, актинмен байланысқан тіреуіштер. Int. Аян Цитол. Халықаралық цитология шолу. 246. 31-58 бет. дои:10.1016 / S0074-7696 (05) 46002-7. ISBN 9780123646507. PMID 16164966.

[pmid16492705-11] Rachlin AS, Otey CA (2006). «Палладин изоформаларын анықтау және Ласп-1 мен палладин арасындағы изоформалық өзара әрекеттесудің сипаттамасы». J. Cell Sci. 119 (Pt 6): 995-1004. дои:10.1242 / jcs.02825. PMID 16492705.

[pmid17194196-12] Pogue-Geile KL, Chen R, Bronner MP, Crnogorac-Jurcevic T, Moyes KW, Dowen S, Otey CA, Crispin DA, George George, Whitcomb DC, Brentnall TA (2006). «Палладин мутациясы отбасылық асқазан безінің қатерлі ісігін тудырады және қатерлі ісіктің жаңа механизмін ұсынады». PLOS Med. 3 (12): e516. дои:10.1371 / journal.pmed.0030516. PMC 1751121. PMID 17194196.

[pmid17455999-13] Слейтер Е, Амриллаева В, Фендрих В, Бартш Д, Эрл Дж, Витон LJ, Неоптолемос Дж.П., Гринхалф W (2007). «Палладин мутациясы отбасылық асқазан безінің қатерлі ісігін тудырады: еуропалық отбасыларда жоқ». PLOS Med. 4 (4): e164. дои:10.1371 / journal.pmed.0040164. PMC 1855695. PMID 17455999.

[pmid17415588-14] Zogopoulos G, Rothenmund H, Eppel A, Ash C, Akbari MR, Hedley D, Narod SA, Gallinger S (2007). «Палладин P239S нұсқасы тұқым қуалайтын немесе ерте басталған ұйқы безі қатерлі ісігінің маңызды бөлігін есепке алмайды». Хум. Генет. 121 (5): 635–7. дои:10.1007 / s00439-007-0361-z. PMID 17415588. S2CID 2445261.

[pmid17404500-15] Salaria SN, Illei P, Sharma R, Walter KM, Klein AP, Eshleman JR, Maitra A, Schulick R, Winter J, Ouellette MM, Goggins M, Hruban R (2007). «Палладин ұйқы безінің инфильтратты каналды аденокарциномаларының неопластикалық емес стромасында шамадан тыс әсер етеді, бірақ тек жаңа қабықшаларда сирек кездеседі». Қатерлі ісік биолы. Тер. 6 (3): 324–8. дои:10.4161 / cbt.6.3.3904. PMC 3144721. PMID 17404500.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

Navigation