WikiDer > PRMT1 - Википедия

PRMT1 - Wikipedia
PRMT1
Protein PRMT1 PDB 1or8.png
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарPRMT1, ANM1, HCP1, HRMT1L2, IR1B4, протеин аргинин метилтрансфераза 1
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 602950 MGI: 107846 HomoloGene: 21477 Ген-карталар: PRMT1
EC нөмірі2.1.1.321
Геннің орналасуы (адам)
19-хромосома (адам)
Хр.19-хромосома (адам)[1]
19-хромосома (адам)
Genomic location for PRMT1
Genomic location for PRMT1
Топ19q13.33Бастау49,675,786 bp[1]
Соңы49,689,029 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE PRMT1 206445 s at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез

3276

15469

Ансамбль

ENSG00000126457

ENSMUSG00000109324

UniProt

Q99873

Q9JIF0

RefSeq (mRNA)

NM_001207042
NM_001536
NM_198318
NM_198319

NM_001252476
NM_001252477
NM_019830

RefSeq (ақуыз)

NP_001193971
NP_001527
NP_938074

NP_001239405
NP_001239406
NP_062804

Орналасқан жері (UCSC)Хр 19: 49.68 - 49.69 MbChr 7: 44.98 - 44.99 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Ақуыз аргинині N-метилтрансфераза 1 болып табылады фермент адамдарда кодталған PRMT1 ген.[5] HRMT1L2 гені ақуызды кодтайды аргинин метилтрансфераза ретінде жұмыс істейді гистон метилтрансфераза үшін арнайы гистон H4.[6]

Функция

PRMT1 гені ақуызды кодтайды аргинин метилтрансфераза ретінде жұмыс істейді гистон метилтрансфераза үшін арнайы гистон H4 эукариотты жасушаларда.[6] Эукариоттардағы гистон Н4-ті нақтылап өзгерту, оған трансляциядан кейінгі модификатор ретінде әрекет ететін хроматинді қайта құруға мүмкіндік береді.[7]

Гендердің экспрессиясын реттеу арқылы аргинин метилтрансферазалар жасуша циклін және эукариотты жасушалардың өлуін басқарады.[7]

Реакция жолы

Барлық PRMT ферменттері ақуыздардағы аргинин қалдықтарының метилденуін катализдейді, ал PRMT1 симметриялы диметилденген аргининнің түзілуін катализдейтін PRMT2-ге қарағанда асимметриялы диметилденген аргинин түзілуін катализдейді.[8] Жеке PRMT пайдаланады S-аденозил-L-метионин (SAM) метил доноры ретінде және метил тобын аргинин қалдықтарының ω-азотына ауыстыруды катализдейді.[8]

Клиникалық маңызы

Адамдарда бұл ферменттер гендердің экспрессиясын реттейді, демек адамның көптеген ауруларының патогенезіне қатысады.[9] Аргинин метилтрансфераза 1 ферментінің ингибиторларын қолдана отырып, зерттеулер әр түрлі қатерлі ісіктердің ерте катализаторы ретінде ферменттің потенциалын көрсете алды.[9][8][10]

Өзара әрекеттесу

PRMT1 көрсетілді өзара әрекеттесу бірге:

Үлгілі организмдер

Үлгілі организмдер PRMT1 функциясы мен құрылымын зерттеу үшін қолданылған.

Шартты тінтуір сызық, деп аталады Прмт1tm1a (EUCOMM) Wtsi[24][25] бөлігі ретінде құрылды Халықаралық нокаутты тышқан консорциумы бағдарлама - жануарлардың аурулар моделін құруға және қызығушылық танытқан ғалымдарға таратуға мүмкіндік беретін мутагенездің жоғары жобасы.[26][27][28]

Еркек пен аналық жануарлар стандартталған түрде өтті фенотиптік экран жоюдың әсерін анықтау.[22][29] Жиырма үш сынақ өткізілді мутант тышқандар және үш маңызды ауытқулар байқалды.[22] Жоқ гомозиготалы мутант эмбриондар жүктілік кезінде анықталды, сондықтан бірде-біреуі тірі қалмады емшектен шығару. Қалған сынақтар өткізілді гетерозиготалы мутантты ересек тышқандар мен әйелдердің айналымы жоғарылаған креатинин деңгейлер.[22]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б в GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000126457 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б в GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000109324 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Скотт Х.С., Антонаракис С.Е., Лалиоти MD, Россье С, Күміс Пенсильвания, Генри М.Ф. (маусым 1998). «Адамның аргининді метилтрансферазаларының (HRMT1L1 және HRMT1L2) екі болжамын анықтау және сипаттамасы». Геномика. 48 (3): 330–40. дои:10.1006 / geno.1997.5190. PMID 9545638.
  6. ^ а б «Entrez Gene: PRMT1 ақуыз аргинин метилтрансфераза 1».
  7. ^ а б Цянь К, Чжэн Г (2016-01-01). «8 тарау - Аргининді метилтрансфераза ингибиторларының қазіргі дамуы». Медина-Франко JL-де (ред.) Epi-информатика. Бостон: Academic Press. 231–256 бет. дои:10.1016 / b978-0-12-802808-7.00008-3. ISBN 978-0-12-802808-7.
  8. ^ а б в Obianyo O, Osborne TC, Thompson PR (қыркүйек 2008). «Аргинин метилтрансфераза 1 ақуызының кинетикалық механизмі». Биохимия. 47 (39): 10420–7. дои:10.1021 / bi800904m. PMC 2933744. PMID 18771293.
  9. ^ а б Ценг Х, Сю В (2015-01-01). «16 тарау - гистон метилтрансфераза ферменттерінің ферментативті анализі». Чжэн Ю.Г. (ред.) Эпигенетикалық технологиялық қосымшалар. Бостон: Academic Press. 333–361 бет. дои:10.1016 / b978-0-12-801080-8.00016-8. ISBN 978-0-12-801080-8.
  10. ^ Carbone F, Montecucco F, Xu S, Banach M, Jamialahmadi T, Sahebkar A (тамыз 2020). «Атеросклероз кезіндегі эпигенетика: негізгі ерекшеліктері және терапиялық әсері». Терапевтік мақсаттар туралы сарапшылардың пікірі. 24 (8): 719–721. дои:10.1080/14728222.2020.1764535. PMID 32354276.
  11. ^ а б Lin WJ, Gary JD, Yang MC, Clarke S, Herschman HR (маусым 1996). «Сүтқоректілердің ерте-ерте TIS21 ақуызы және лейкозға байланысты BTG1 ақуызы ақуыз-аргинин N-метилтрансферазамен өзара әрекеттеседі». Дж.Биол. Хим. 271 (25): 15034–44. дои:10.1074 / jbc.271.25.15034. PMID 8663146.
  12. ^ а б Berthet C, Guéhenneux F, Revol V, Samarut C, Lukaszewicz A, Dehay C, Dumontet C, Magaud JP, Rouault JP (қаңтар 2002). «PRMT1-нің BTG / TOB ақуыздарымен жасушалық сигнализациядағы өзара әрекеттесуі: молекулалық талдау және функционалдық аспектілері». Ген жасушалары. 7 (1): 29–39. дои:10.1046 / j.1356-9597.2001.00497.x. PMID 11856371. S2CID 15016952.
  13. ^ Смит В.А., Шуртер Б.Т., Вонг-Стаал Ф, Дэвид М (мамыр 2004). «РНҚ-геликазаның аргининді метилденуі оның жасуша ішіндегі оқшаулауын анықтайды». Дж.Биол. Хим. 279 (22): 22795–8. дои:10.1074 / jbc.C300512200. PMID 15084609.
  14. ^ а б Ли Дж, Бедфорд МТ (наурыз 2002). «PABP1 жоғары тығыздықты ақуыз массивтерін қолдана отырып аргинин метилтрансфераза субстраты ретінде анықталды». EMBO Rep. 3 (3): 268–73. дои:10.1093 / embo-report / kvf052. PMC 1084016. PMID 11850402.
  15. ^ а б в Вада К, Иноуэ К, Хагивара М (тамыз 2002). «Аргинин N-метилтрансфераза 1, PRMT1 протеинімен метилирленген ақуыздарды анықтау, жаңа экспрессияны клондау стратегиясымен». Биохим. Биофиз. Акта. 1591 (1–3): 1–10. дои:10.1016 / s0167-4889 (02) 00202-1. PMID 12183049.
  16. ^ а б Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (қыркүйек 2005). «Адамның ақуыз бен ақуыздың өзара әрекеттесу желісі: протеомды аннотациялауға арналған ресурс». Ұяшық. 122 (6): 957–68. дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
  17. ^ а б Côté J, Boisvert FM, Boulanger MC, Bedford MT, Richard S (қаңтар 2003). «Sam68 РНҚ байланыстыратын ақуыз - бұл аргинин N-метилтрансфераза 1 үшін in vivo субстрат». Мол. Биол. Ұяшық. 14 (1): 274–87. дои:10.1091 / mbc.E02-08-0484. PMC 140244. PMID 12529443.
  18. ^ Абрамович С, Якобсон Б, Чебат Дж, Ревель М (қаңтар 1997). «Протеин-аргинин метилтрансфераза I типті интерферон рецепторында IFNAR1 тізбегінің интрацитоплазмалық доменімен байланысады». EMBO J. 16 (2): 260–6. дои:10.1093 / emboj / 16.2.260. PMC 1169633. PMID 9029147.
  19. ^ Tang J, Kao PN, Herschman HR (маусым 2000). «Протеин-аргинин метилтрансфераза I, жасушалардағы белок-аргинин метилтрансферазаның басым бөлігі, интерлейкинді күшейтетін 3-фактормен әсерлеседі және олармен реттеледі». Дж.Биол. Хим. 275 (26): 19866–76. дои:10.1074 / jbc.M000023200. PMID 10749851.
  20. ^ Kwak YT, Guo J, Prajapati S, Park KJ, Surabhi RM, Miller B, Gehrig P, Gaynor RB (сәуір 2003). «SPT5 метилденуі оның РНҚ-полимераз II-мен өзара әрекеттесуін және транскрипциялық созылу қасиеттерін реттейді». Мол. Ұяшық. 11 (4): 1055–66. дои:10.1016 / s1097-2765 (03) 00101-1. PMID 12718890.
  21. ^ «Prmt1 арналған клиникалық химия деректері». Wellcome Trust Sanger институты.
  22. ^ а б в г. Гердин А.К. (2010). «Sanger Mouse генетикасы бағдарламасы: нокаут тышқандарының жоғары сипаттамасы». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  23. ^ Тышқанның ресурстар порталы, Wellcome Trust Sanger институты.
  24. ^ «Халықаралық нокаутты тышқан консорциумы».
  25. ^ «Тышқан геномының информатикасы».
  26. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Стюарт AF, Bradley A (2011). «Тышқанның генінің қызметін геном бойынша зерттеу үшін шартты нокаут ресурсы». Табиғат. 474 (7351): 337–342. дои:10.1038 / табиғат10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
  27. ^ Долгин Е (2011). «Тышқан кітапханасы нокаутқа айналды». Табиғат. 474 (7351): 262–3. дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
  28. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж, Вурст В (2007). «Барлық себептерге арналған тышқан». Ұяшық. 128 (1): 9–13. дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  29. ^ Ван дер Вейден Л, Уайт Дж., Адамс Ди-джей, Логан DW (2011). «Тышқанның генетикасына арналған құрал: функциясы мен механизмін анықтау». Геном Биол. 12 (6): 224. дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.

Әрі қарай оқу

Сыртқы сілтемелер

  • Сайтында қол жетімді барлық құрылымдық ақпаратқа шолу PDB үшін UniProt: Q99873 (Аргинин N-метилтрансфераза 1 ақуызы) PDBe-KB.