WikiDer > MvirDB - Википедия

MvirDB - Wikipedia
MvirDB
Мазмұны
СипаттамаУытты заттар, вируленттілік факторлары және антибиотиктерге төзімділік гендері туралы мәліметтер базасы
Мәліметтер түрлері
қолға түсті		Уытты заттар, вируленттік факторлар және антибиотиктерге төзімділік гендері
АғзаларБактериялар
Байланыс
Бастапқы дәйексөзPMID 17090593
Кіру
Веб-сайтmvirdb.llnl.gov
Әр түрлі
Бетбелгі
субъектілер		иә

Жылы молекулалық биология, MvirDB жалпыға қол жетімді дерекқор туралы ақпаратты сақтайтын токсиндер, вируленттілік факторлары және антибиотикке төзімділік гендер.[1] Бұл дерекқор пайдаланатын көздер ДНҚ және ақуыз ақпаратқа мыналар кіреді: Tox-Prot,[2] SCORPION,[3] PRINTS вируленттік факторлары,[4][5] VFDB,[6] TVFac, арал,[7] АРГО[8] және VIDA.[9] Деректер базасы a Жарылыс пайдаланушыға олардың барлығына өз кезектілігін сұрауға мүмкіндік беретін құрал ДНҚ және ақуыз MvirDB-де реттілік. Туралы ақпарат вируленттілік факторлары ұсынылған шолғыш құралын пайдалану арқылы алуға болады. Браузер құралын қолданғаннан кейін, нәтижелер оқылатын кесте ретінде шығарылады, ол E-мәндерінің жоғарылауы бойынша ұйымдастырылады, олардың әрқайсысы өздеріне қатысты параққа сілтеме жасайды. MvirDB жүзеге асырылады Oracle 10g реляциялық мәліметтер базасы.[1]

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б Чжоу, С .; Смит, Дж .; Лам, М .; Земла, А .; Дайер, М. Д .; Слезак, Т. (2007-01-03). «MvirDB - биологиялық қорғанысқа арналған протеин токсиндерінің, вируленттілік факторларының және антибиотиктерге төзімділік гендерінің микробтық базасы». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 35 (Дерекқор): D391 – D394. дои:10.1093 / nar / gkl791. ISSN 0305-1048. PMC 1669772. PMID 17090593.
  2. ^ Джунго, Флоренция; Байроч, Амос (наурыз 2005). «Tox-Prot, Швейцария-Прот протеинінің ақпараттық базасының токсинді протеинге аннотация бағдарламасы». Токсикон. 45 (3): 293–301. дои:10.1016 / j.toxicon.2004.10.018. ISSN 0041-0101.
  3. ^ Шринивасан, К.Н .; Гопалакришнаконе, П .; Тан, П.Т .; Чив, К.С .; Ченг, Б .; Кини, Р.М .; Ко, Дж. Й .; Seah, S.H .; Brusic, V. (қаңтар 2002). «SCORPION, скорпион токсиндерінің молекулалық базасы». Токсикон. 40 (1): 23–31. дои:10.1016 / s0041-0101 (01) 00182-9. ISSN 0041-0101.
  4. ^ «Автор индексі 15-том, No1, 2008». Молекулалық микробиология және биотехнология журналы. 15 (1): 65. 2008. дои:10.1159/000121450. ISSN 1464-1801.
  5. ^ Аттвуд, Тереза ​​К .; Брэдли, Пол М .; Готтон, Анна; Модлинг, Нил; Митчелл, Александр Л .; Моултон, Джорджина (2005-04-15), «PRINTS ақуыз саусақ іздері базасы: функционалды және эволюциялық қолдану», Генетика, геномика, протеомика және биоинформатика энциклопедиясы, John Wiley & Sons, Ltd, дои:10.1002 / 047001153x.g306301, ISBN 047001153X
  6. ^ Чен, Л. (2004-12-17). «VFDB: бактериялық вируленттілік факторларының анықтамалық базасы». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 33 (Деректер базасы мәселесі): D325 – D328. дои:10.1093 / nar / gki008. ISSN 1362-4962. PMC 539962. PMID 15608208.
  7. ^ Мантри, Ю. (2004-01-01). «Islander: прокариоттық геномдардағы интегративті аралдардың базасы, онымен байланысты интегралдар және олардың ДНҚ орналасу ерекшеліктері». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 32 (90001): 55D – 58. дои:10.1093 / nar / gkh059. ISSN 1362-4962. PMC 308793. PMID 14681358.
  8. ^ Скария, қуаныш; Чандрамоули, Умамахесваран; Верма, Санджай Кумар (2005-02-01). «Антибиотиктерге төзімділік гендері (ARGO): ванкомицин мен б-лактамға төзімділік гендері туралы мәліметтер базасы». Биоақпарат. 1 (1): 5–7. дои:10.6026/97320630001005. ISSN 0973-8894. PMID 17597841.
  9. ^ Иитс, С .; Лис, Дж .; Рейд, А .; Келлам, П .; Мартин, Н .; Лю, Х .; Orengo, C. (2007-12-23). «Gene3D: геномдардың құрылымдық-функционалды аннотациясы». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 36 (Дерекқор): D414 – D418. дои:10.1093 / nar / gkm1019. ISSN 0305-1048.