WikiDer > Қыша дерекқоры

Mustard Database
Қыша
Мазмұны
СипаттамаҚұрамында метагеномикадан анықталған AR детерминанттары және курацияланған AR гендері бар
Мәліметтер түрлері
қолға түсті		Микробқа қарсы тұрақтылық гендері және АР детерминанттары
АғзаларБактериялар
Байланыс
Бастапқы дәйексөзPMID 30478291
Кіру
Веб-сайтмгс.ЕО/ Қыша/
Жүктеу URLЖүктеу
Әр түрлі
Бетбелгі
субъектілер		иә

Қыша бақылауды жүзеге асыратын мәліметтер базасы болып табылады Микробқа қарсы тұрақтылықты анықтайтын заттар (ARDS). ARD-ді қадағалау әдісі ақуыздың гомологиялық моделдеуінен бейімделген протеинді болжауды жоғарылататын жұптық салыстырмалы модельдеу (PCM) деп аталатын өз әдісін қолданады, әсіресе протеин гомологтары үшін.[1] PCM көмегімен адамның ішек микробиотасындағы 20 отбасының 6095 ARD-і. Антибиотиктерге төзімділік туралы мәліметтер базасы пайдаланылды ResFinder,[2] ARG-ANNOT,[3] қазір жұмыс істемейтін Лахей клиникасы,[4] Тетрациклин мен макролидтерге төзімділік гендеріне арналған Мэрилин Робертстің веб-сайты[5] және метагеномика.[6][7][8]

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Эрлих, С.Дуско; Кеннеди, Шон П .; Доре, Джоэл; Хаймет, Флоренция; Вайзер, Кевин; Левенес, Флоренция; Летур, Алин; Лежард, Вероник; Леонард, Пьер (қаңтар 2019). «Ішек резистомын үш өлшемді құрылымға негізделген әдіспен болжау» (PDF). Табиғат микробиологиясы. 4 (1): 112–123. дои:10.1038 / s41564-018-0292-6. ISSN 2058-5276. PMID 30478291. S2CID 53757858.
  2. ^ Занкари, Е .; Хасман, Х .; Косентино, С .; Вестергаард, М .; Расмуссен, С .; Лунд, О .; Aarestrup, F. M .; Ларсен, М.В. (2012-07-10). «Алынған микробқа қарсы тұрақтылық гендерін анықтау». Микробқа қарсы химиотерапия журналы. 67 (11): 2640–2644. дои:10.1093 / jac / dks261. ISSN 0305-7453. PMC 3468078. PMID 22782487.
  3. ^ Гупта, Сушим Кумар; Падманабхан, Бабу Рошан; Диене, Сейдина М .; Лопес-Рохас, Рафаэль; Кемфф, Мари; Ландроуд, Люс; Ролен, Жан-Марк (2013-10-21). «ARG-ANNOT, бактериялардың геномында антибиотиктерге төзімділік гендерін анықтайтын жаңа биоинформатикалық құрал». Микробқа қарсы агенттер және химиотерапия. 58 (1): 212–220. дои:10.1128 / aac.01310-13. ISSN 0066-4804. PMC 3910750. PMID 24145532.
  4. ^ «RED-DB». Алынған 27 шілде, 2019.
  5. ^ «Мэрилин Робертстің сайты».
  6. ^ Аллен, Хизер К; Moe, Люк А; Родбумрер, Джитсупанг; Гаардер, Андра; Handelsman, Jo (2008-10-09). «Функционалды метагеномика шалғайдағы Аляска топырағында әртүрлі β-лактамазаларды анықтайды». ISME журналы. 3 (2): 243–251. дои:10.1038 / ismej.2008.86. ISSN 1751-7362. PMID 18843302. S2CID 16496336.
  7. ^ Мур, Айми М .; Пател, Санкет; Форсберг, Кевин Дж.; Ванг, Бин; Бентли, Гейл; Разия, Ясмин; Цинь, Сюань; Тарр, Филлип I .; Дантас, Гаутам (2013-11-13). «Педиатриялық нәжіс микробиотасы айлағы әртүрлі және жаңа антибиотиктерге төзімділік гендері». PLOS ONE. 8 (11): e78822. дои:10.1371 / journal.pone.0078822. ISSN 1932-6203. PMID 24236055.
  8. ^ Зоммер, М.О.А .; Дантас, Г .; Шіркеу, Г.М. (2009-08-27). «Адам микрофлорасындағы антибиотиктерге төзімділік резервуарының функционалды сипаттамасы». Ғылым. 325 (5944): 1128–1131. дои:10.1126 / ғылым.1176950. ISSN 0036-8075. PMC 4720503. PMID 19713526.