WikiDer > Купе вирусы

Kupe virus
Ортонайровирус
Вирустардың жіктелуі e
(ішілмеген):Вирус
Патшалық:Рибовирия
Корольдігі:Орторнавира
Филум:Негарнавирикота
Сынып:Эллиовирицеттер
Тапсырыс:Бунявиралес
Отбасы:Наировирида
Тұқым:Ортонайровирус
Штамм

Купе вирусы

Купе вирусы тұқымдас вирус Ортонайровирус, тапсырыс Бунявиралес.

Таксономия

Ганжам вирусы Найроби қой ауруы серогруппасында орналасқан.

Тарих

Вирус жинақталғаннан оқшауланды кенелер (Amblyomma gemma және Rhipicephalus pulchellus) мал терілерінен жиналған Найроби, Кения, 1999 жылдың қазанында.[1] 'Купе' сөзі Кисвахили кене үшін.

Геном

Геном теріс сезімтал РНҚ-ның үш тізбектен тұрады - шағын (S), орташа (M0 және үлкен (L).

L сегментінің РНҚ-сы - 12,330 нуклеотидтер (nt) ұзындығы бойынша және 4050 амин қышқылынан тұратын бір ашық оқылым шеңберін (ORF) кодтайды. Кодталмаған аймақтар бар: 5 ′ облысы 40 нт және 3 ′ облысы 137 нт. Бұл ашық оқу шеңбері бірнеше модульдерді кодтайды, соның ішінде РНҚ-ға тәуелді РНҚ-полимераза. Бұл аудармадан кейін бірнеше ақуызға бөлінген шығар, бірақ бұл әлі көрсетілмеген.

M сегментінің РНҚ-сы 4818 нуклеотидті құрайды және 47 және 121 нуклеотидтердің сәйкесінше 5 ′ және 3 ′ кодталмайтын аймақтарымен қоршалған бір ашық оқу шеңберін қамтиды. ORF 1549 амин қышқылынан тұратын ақуызды N-байланысқан гликозилдену үшін 8 потенциалды алаңмен кодтайды. Оның құрамында сәйкесінше 612 және 1514 аминқышқылдарындағы Gn және Gc гликопротеин аймақтарындағы бірегей потенциалды N-гли орны бар.

S сегментінде 1,694 нт бар және 483 амин қышқылынан тұратын ORF кодталады. 5 ′ және 3 ′ кодталмайтын аймақтардың ұзындығы сәйкесінше 49 нт және 193 нт құрайды.

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Sang R, Onyango C, Gachoya J, Mabinda E, Konongoi S, Ofula V, Dunster L, Okoth F, Coldren R, Tesh R, da Rossa AT, Finkbeiner S, Wang D, Crabtree M, Miller B (2006) Tickborne arbovirus нарықтық малға қадағалау, Найроби, Кения. Emerg Infect Dis. 2006 шілде; 12 (7): 1074-1080