WikiDer > GGDEF домені
| GGDEF домені | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 c-diGMP-мен кешенді реактивті реттеуші PleD | |||||||||
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | GGDEF | ||||||||
| Pfam | PF00990 | ||||||||
| Pfam ру | CL0276 | ||||||||
| InterPro | IPR000160 | ||||||||
| SCOP2 | 1w25 / Ауқымы / SUPFAM | ||||||||
| CDD | CD01949 | ||||||||
| |||||||||
Молекулалық биологияда GGDEF домені Бұл белоктық домен барлық жерде кездесетін көрінеді бактериялар және көбінесе a сияқты доменмен байланысты фосфорлану қабылдағыш немесе оттегі сезімтал домен. Оның функциясы а ретінде әрекет ету болып табылады дигуанилатциклаза және синтездеу циклдік ди-GMPретінде пайдаланылады жасушаішілік сигнал беру молекула әр түрлі бактериялар.[1][2] Ферментативті белсенділікке іргелес жер қатты әсер етуі мүмкін домендер. Осы доменмен реттелетін процестерге жатады экзополисахарид синтез, биофильм қалыптастыру, моторикасы және жасушалардың дифференциациясы.
Құрылымдық бастап PleD зерттеуі Caulobacter crescentus бұл доменнің бес тізбекті құрайтындығын көрсетіңіз бета парағы қоршалған спираль, ұқсас каталитикалық өзегі аденилатциклаза.[3]
Әдебиеттер тізімі
- ^ Paul R, Weiser S, Amiot NC, Chan C, Schirmer T, Giese B, Jenal U (наурыз 2004). «Ди-гуанилат циклазасының жаңа шығатын доменімен бактериялық реакция реттегішінің жасушалық циклге тәуелді динамикалық оқшаулауы». Genes Dev. 18 (6): 715–27. дои:10.1101 / gad.289504. PMC 387245. PMID 15075296.
- ^ Рыженков Д.А., Тарутина М, Москвин О.В., Гомельский М (наурыз 2005). «Циклдік дигуанилат - бұл бактериялардың барлық жерде кездесетін сигналдық молекуласы: GGDEF ақуыздар аймағының биохимиясына түсініктер». Бактериол. 187 (5): 1792–8. дои:10.1128 / JB.187.5.1792-1798.2005. PMC 1064016. PMID 15716451.
- ^ Chan C, Paul R, Samoray D, Amiot NC, Giese B, Jenal U, Schirmer T (желтоқсан 2004). «Дигуанилатциклазаның белсенділігі мен аллостериялық бақылауының құрылымдық негіздері». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 101 (49): 17084–9. дои:10.1073 / pnas.0406134101. PMC 535365. PMID 15569936.