WikiDer > AceDB

AceDB

AceDB Бұл биологиялық мәліметтер базасы геномдық мәліметтермен жұмыс істеуге арналған. Ол әзірледі Ричард М.Дурбин және Жан Тьерри-Миг 1989 ж.[1] AceDB сөзі C. elegans мәліметтер базасы. Бастапқыда AceDB нематод құртына арналған мәліметтер қоры ретінде құрылғанымен, ол басқа түрлерге арналған ақпаратты сақтау үшін қолданылған мәліметтер базасының бағдарламалық жасақтамасын білдіреді. Өзінің веб-сайтына сәйкес, AceDB икемділікті ескере отырып, стандартты емес деректер моделімен реттелетін деректер базасының ядросын ұсынады. Мысалы, ағзаға арналған AceDB данасы бар Pristionchus pacificus AppaDB деп аталады.[2] AceDB функционалдығының көп бөлігі C. elegans арқылы қол жетімді болды WormBase дерекқор.[3]

Мүмкіндіктер:

  • графикалық интерфейс, көптеген нақты дисплейлер мен геномдық мәліметтерге арналған құралдар
  • ашық бастапқы бағдарламалық жасақтама
  • мәліметтер базасына кез келген жерден қол жеткізуге мүмкіндік беретін қарапайым веб-шолғыш интерфейсін іске асыратын пакет
  • Интерфейстер perl, Java және CORBA көмегімен оңай
  • Салыстырмалы геномды талдау құралдары, соның ішінде Оксфорд торы, Хромосомалардың жұптық картасы, Көпшілікке арналған хромосомалар картасы, Түрлер торы, Транслокация торы
  • филогенетикалық мәліметтермен жұмыс істеу қабілеті
  • [Cmap | http: //soybeanbreederstoolbox.org/] сияқты сыртқы қосымшаларға оңай сілтеме жасайды.
  • Unix операциялық жүйесінің астында, графикаға арналған X-Windows қолдана отырып, мәліметтер базасының файлдарының жергілікті көшірмесімен жұмыс жасау үшін әзірленген

AceDB-де даму тоқтаған сияқты, өйткені интерфейс бұрынғы технологияны қолданады және оны қолданған көптеген сайттар жаңа бағдарламалық жасақтамаға көшті.

Бағдарламалық жасақтаманың қосымша экран суреттерін веб-сайттан көре аласыз Жылдам нұсқаулық.

Бірізділікті туралаудың бірнеше көрінісі

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Eeckman FH, Durbin R (1995). «ACeDB және macace». Жасуша биолы әдістері. 48: 583–605. дои:10.1016 / s0091-679x (08) 61405-3. PMID 8531744.
  2. ^ Шринивасан Дж, Отто Г.В., Кахлоу У, Гейслер Р, Соммер Р.Ж. (қаңтар 2004). «AppaDB: Pristionchus pacificus жер серігі ағзаларына арналған AcedB дерекқоры». Нуклеин қышқылдары. 32 (Деректер базасы мәселесі): D421–2. дои:10.1093 / nar / gkh057. PMC 308791. PMID 14681447.
  3. ^ Stein L, Sternberg P, Durbin R, Thierry-Mieg J, Spieth J (қаңтар 2001). «WormBase: геномға және канорабдит элеганстарының биологиясына қол жетімділік». Нуклеин қышқылдары. 29 (1): 82–6. дои:10.1093 / нар / 29.1.82. PMC 29781. PMID 11125056.

Сыртқы сілтемелер